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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 坐标轴 分子坐标
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天下枫叶

木虫 (著名写手)

[求助] 坐标轴 分子坐标

可能是我的表达有问题，我想问的是：如何才能让z轴垂直于分子平面，而xy轴与分子平面共面，有些时候在GaussianView当中画出的分子构型以及在Gaussian输出文件中的分子构型是y或z轴垂直于分子平面，而z轴却在分子平面内。如何调整坐标可以使z轴垂直于分子平面，
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1楼 2011-05-31 14:54:19
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liuzhengjun0427

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

天下枫叶(金币+1): 你的意思是说，分子动但坐标不动是吧 2011-06-01 17:12:09
在GaussianView里按住alt键移动分子，可以间接的移动坐标轴。
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2楼2011-06-01 15:47:55
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天下枫叶

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by liuzhengjun0427 at 2011-06-01 15:47:55:
在GaussianView里按住alt键移动分子，可以间接的移动坐标轴。

但是你怎么设置平面
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3楼2011-06-01 17:17:26
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sangym

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

天下枫叶(金币+1): 推荐一个 2011-06-01 23:20:26
你必须在gassview里吗？？别的软件可以的
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4楼2011-06-01 20:59:44
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liuzhengjun0427

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 天下枫叶 at 2011-06-01 17:17:26:
但是你怎么设置平面

gaussianview好像只能用你的眼睛看了，只能大概在坐标轴移到平面上，chemcraf这个软件也很好用，可以很方便的移动坐标轴，你可以试试。
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5楼2011-06-02 08:35:03
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天下枫叶

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by liuzhengjun0427 at 2011-06-02 08:35:03:
gaussianview好像只能用你的眼睛看了，只能大概在坐标轴移到平面上，chemcraf这个软件也很好用，可以很方便的移动坐标轴，你可以试试。

但是文献报道的好像都是在Gaussian里处理的，见文献（附件），本人对这一块不是很懂，你说的按住Alt键确实可以转动分子，但对文献里怎么设置，我就很迷糊，
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6楼2011-06-02 10:48:01
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天下枫叶

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by sangym at 2011-06-01 20:59:44:
你必须在gassview里吗？？别的软件可以的

你好，在Gaussian里能实现分子对接吗
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7楼2011-06-02 10:49:56
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天下枫叶

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by sangym at 2011-06-01 20:59:44:
你必须在gassview里吗？？别的软件可以的

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3244036&pid=628877&page=1#pid628877能不能帮我看一下这个帖子吗
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8楼2011-06-02 10:52:45
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sangym

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

天下枫叶(金币+2): 谢谢啊 2011-06-02 12:42:44
引用回帖:
Originally posted by 天下枫叶 at 2011-06-02 10:52:45:
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3244036&pid=628877&page=1#pid628877能不能帮我看一下这个帖子吗

从CCDC里现在你导出结构了吗？？要是没导出我可以给你找，然后发给你！！！要是找到了你可以用ultraedit打开试试，给我发过来，帮你改成gassview能读的格式，要是这个都已经完成的话，要改坐标轴建议你试试Material Studio这个软件可以改！！祝好运
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9楼2011-06-02 11:13:24
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天下枫叶

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by sangym at 2011-06-02 11:13:24:
从CCDC里现在你导出结构了吗？？要是没导出我可以给你找，然后发给你！！！要是找到了你可以用ultraedit打开试试，给我发过来，帮你改成gassview能读的格式，要是这个都已经完成的话，要改坐标轴建议你试试Mat ...

CCDC我们这边好像打不开，还有昨晚我试了一下将GaussianView里的文件导入MS5.0里只看到文本而没有立体结构，不知道怎么回事，格式是保存为mol
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10楼2011-06-02 12:20:08
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