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阿三阿里宝宝

新虫 (初入文坛)

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[求助] LAMMPS special_bonds 用法

LAMMPS手册上说，special_bonds命令是给1-2,1-3,1-4相互作用的设定权重系数，但是important note 部分我实在是看不懂说的是什么，请各位给解释下啊。还有，如果weighted coefficients 都设为0，是不是就不会计算pair，angle和dihedral势能了呢？那样的话，是不是in文件里定义的pair，angle和dihedral势能部分就不会起作用了？在什么情况下，可以用到这个命令呢？谢谢！

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1楼 2011-05-31 11:28:33

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数峰青820

新虫 (初入文坛)

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你好，我也在看这个，是个初学者。根据“Set weighting coefficients for pairwise energy and force contributions between pairs of atoms”这句话，我认为special_bonds是针对pair atoms加权的，也就是如果都设为0的话，那么1-2、1-3、1-4这三个类型的原子对之间的pairwise interactions就不会再计算了，但是由于我们也用了pair_style，所以在截断半径内除了这三个类型的所有pairwise interactions都还起作用的，并且，如果in文件中定义了angle_style和dihedral_style的话，那么这些命令都还会起作用的。不知道我说的对不对，如果有误，还请指正告知，大家共同进步。另，我有个疑问，为什么special_bonds只对1-2、1-3、1-4这三个类型的pairwise interactions加权，1-5及以上的呢？可能我的回答和问题都有点幼稚，但却是是我所知和我所惑啊谢谢！