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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 核定位信号（NLS）以及C端酸性区域怎么用软件来确定啊？
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magy2006

木虫 (著名写手)

[求助] 核定位信号（NLS）以及C端酸性区域怎么用软件来确定啊？

对于一个转录因子的氨基酸序列，其核定位信号（NLS）以及C端酸性区域怎么用软件来确定啊？大家有没有做过类似的分析？用到什么样的软件啊?
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1楼 2011-05-31 10:07:37
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iaminxanadu

木虫 (正式写手)
是不是可以做序列比对分析啊

而且最好是通过实验做吧，做个C端N端缺失突变之类的。。。。
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2楼2011-05-31 10:31:17
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magy2006

木虫 (著名写手)
楼上说的应该不是简单的方法
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3楼2011-05-31 10:33:14
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iaminxanadu

木虫 (正式写手)
软件分析只能是初步的推断啊
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4楼2011-05-31 15:46:46
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chicharito

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

magy2006(金币+5): 提供的信息比较有用，但还不是最佳答案 2011-05-31 20:24:59
内容已删除
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姿态----
5楼2011-05-31 17:01:20
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magy2006

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by chicharito at 2011-05-31 17:01:20:
我也想知道。。。 貌似我看一个文献上说 有 软件 predict NLS 和 PSORT II 推测核定为信号的， 但是我没找到这些软件。楼主大人明白了告诉小弟一声，谢谢啊

在GOOGLE里面一搜就出来了，很简单，不过第二个是酵母和动物的，没有植物，可惜。第一个很不准确，而且只能用三次，三次后就需要收费了……
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6楼2011-05-31 20:26:24
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magy2006

木虫 (著名写手)
有没有更好的答案呢？
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7楼2011-06-02 15:27:59
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此生不离

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by chicharito at 2011-05-31 17:01:20
我也想知道。。。 貌似我看一个文献上说 有 软件 predict NLS 和 PSORT II 推测核定为信号的， 但是我没找到这些软件。楼主大人明白了告诉小弟一声，谢谢啊

http://nls-mapper.iab.keio.ac.jp/cgi-bin/NLS_Mapper_form.cgi#opennewwindow
http://www.sbc.su.se/~maccallr/nucpred/#opennewwindow
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8楼2017-04-10 15:25:54
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