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求助:基因组文库构建时一般用什么Marker?
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zct2008
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专业: 微生物生理与生物化学
[
求助
]
求助:基因组文库构建时一般用什么Marker?
本人正在构建一个细菌基因组文库,按照《分子克隆实验指南》,提取全基因组以后用Sau3AI进行部分酶切,然后电泳分离30-45kb大小的片段。想请教一下大家:电泳分离30-45kb大小的片段时一般用什么Marker?一般常用的Marker没有这么大的,不知道大家都是用什么作为分子量标准的?请做过基因组文库构建的朋友帮忙,非常感谢!
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1楼
2011-05-30 09:27:26
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引用回帖:
Originally posted by
srlee
at 2011-07-08 10:46:14:
λHindIII 最大条带确实是23Kb,如果是低电压过夜电泳(脉冲场电泳就另说了)的话,建文库要割胶回收的30-40K条带也就在23kb上面一点点,如果建文库时找不到40kb左右的marker完全可以用它指示一下,等你做的多 ...
我要跑的就是脉冲场电泳。。。那还能不能用λHindIII ?分离大片段DNA是不是一定要用脉冲场电泳?
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9楼
2011-07-08 14:34:02
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专业: 微生物生理与生物化学
自己顶一下,继续求助。
有没有做过基因组文库构建的朋友?请帮帮忙,非常感谢!
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2楼
2011-06-01 20:35:28
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dhd997(金币+2): good 2011-06-02 09:07:52
40多KB的可以用λ线性DNA,20多KB的可以用λ/EcoRⅠ,最大的一条带是21.6kb,这两个Ladder分两个泳道上样,割中间区域的胶。
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流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
3楼
2011-06-02 01:13:09
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我要构建的是链霉菌的基因组文库,回收的是30-42kb之间的片段,也在找合适的marker。。。
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4楼
2011-07-03 19:18:46
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