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superfcc

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1楼 2011-05-26 11:23:41
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mike0601

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
御剑江湖(金币+2): xiexie 2011-05-26 23:42:41
superfcc(金币+4): 2011-05-27 08:08:41
在优化的基础上在优化可能没什么用了，不如设置优化的步数再多一些，或者做个模拟退火什么的
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2楼2011-05-26 23:04:05
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superfcc

禁虫 (小有名气)
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3楼2011-05-27 09:09:15
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mike0601

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
superfcc(金币+3): 2011-05-27 09:38:35
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-05-27 22:45:53
引用回帖:
Originally posted by superfcc at 2011-05-27 09:09:15:
模拟退火对分子有要求吗？如果不是药物大分子，比如说苯并咪唑类的小分子也可以模拟退火吗？总体感觉，结构越简单越是不好优化！

小分子也可以。分子简单优化的更快才对
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4楼2011-05-27 09:33:30
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superfcc

禁虫 (小有名气)
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5楼2011-05-27 09:41:47
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mike0601

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

superfcc(金币+2): 2011-05-27 14:50:22
引用回帖:
Originally posted by superfcc at 2011-05-27 09:41:47:
谢谢，我的分子是在COMMOND console 中输入分子的SLN 直接得出的，可能结构比较好了，然后优化会显示能量上升（energy rose）！不过我刚才模拟退火后，优化就行了！不过模拟退火是第一次用，不知道参数设置有什 ...

这个我也不太懂，还得自己去研究探索
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6楼2011-05-27 13:31:21
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superfcc

禁虫 (小有名气)
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7楼2011-05-27 14:50:45
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