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petersen

金虫 (小有名气)

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[求助] 蛋白补残基，各位帮帮忙看下啊！

请问一下：有两个结构，其中一个结构比较完整，另外一个缺少了10个左右氨基酸，但是两个结构的坐标取值不一致，所以直接复制粘贴不行，我想把这10个氨基酸按照那个完整结构的二级结构形式添加到缺失结构的文件中，这个怎么搞？？？

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1楼 2011-05-23 15:29:13

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bbslover

金虫 (正式写手)

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引用回帖:

2楼: Originally posted by bamboosity at 2011-05-23 20:00:05:

叠合两个蛋白结构，坐标就一致了；也可以采取部分结构同源建模的办法补齐（这样麻烦点）。主要看你的目的是什么

你好，我正遇到了这个难题，如何叠合两个蛋白呢？用什么软件啊，然后怎么提取出蛋白坐标，添加到缺失的蛋白坐标中？

我有个蛋白缺少62-69号残基（loop区域），然后我用这个已经解析出来的pdb作为模板，使用swiss-model建立它的同源模型（为了得到完整的蛋白），得到的这个同源模型该怎么和这个蛋白叠合呢？