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gzlaotouzi

铁虫 (初入文坛)

[交流] 实时定量PCR 数据处理 已有6人参与

实验前提：目的基因A，内参基因B，的扩增效率一致；其次每个基因做3个重复孔，3次样本PCR重复。
  处理组3个样本，对照组3个样本，首先，假设对照组为control1、control2、control3号共3个样本，处理组为treat1、treat2、treat3号共3个样本，目的之一是检测目的基因A利用内参B归一化后，在处理组相对对照组表达差异是否有统计学意义。
    其次，分别计算对照组3个对照组样本中△CT（目的基因CT-内参CT），然后计算3个对照组样本△CT的平均值；同时计算103个处理组样本中△CT（目的基因CT-内参CT），然后计算3个处理组样本△CT的平均值。
     目的之二如何计算处理组相对对照组目的基因的表达倍数。

[ Last edited by gzlaotouzi on 2011-5-16 at 21:41 ]
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1楼 2011-05-14 15:39:24
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ht_235

铁杆木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
能在详细一些么？谢谢
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2楼2011-05-16 08:40:56
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gzlaotouzi

铁虫 (初入文坛)
见附件！多讨论
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3楼2011-05-16 21:43:44
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华啾啾
4楼2012-04-24 09:16:35
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sptm1019

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
内参取均值，目的基因分别与内参均值做2−ΔΔCT计算，每组可得三个数据，进行单因素分析
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5楼2012-04-24 10:40:18
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amy110120

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
最近做定量PCR做的很不爽  心情不好啊 啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊
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木有sci,就木有临床,冲啊.....
6楼2012-09-20 09:38:52
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vickie20

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问楼主最后是怎么处理的？我现在也要用实验组和对照组的比值，但是误差怎么处理呢？
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7楼2013-05-06 19:30:06
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faith_hao

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
想问一下楼主，处理组各减去相应的对照后是不是相差也挺大啊。2^后不更大吗？不太懂也不知道理解的对不对。新手一个最近做的很不理想求详细解答
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我未曾见过一个早起、勤奋、谨慎、诚实的人抱怨命运不好；良好的品格，优良的习惯，坚强的意志，是不会被假设所谓的命运击败的。——《富兰克林自传》
8楼2013-05-08 08:22:05
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