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friya0910

新虫 (正式写手)

[求助] 写文章中遇到的问题,望高人指点!叩谢……

我根据别人的cDNA序列设计引物,在DNA上进行扩增后测序,测得四条不同的序列,核苷酸一致性均在80%以上,那我应该怎么称呼这四条基因呢?我能说我的目的基因在基因组中是以多拷贝的形式存在的吗?百度了一下貌似多拷贝基因是要序列一样的,那我测得的四条序列彼此是什么关系呢?要怎么称呼呢?望高人指点!
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friya0910

新虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by jhu132llh at 2011-05-11 21:05:31:
有的可能是假基因
因为有突变而被弃用了

哦……我现在要写论文,请教一下我就说我在基因组扩增得到了四个拷贝,说明该基因在基因组中是以多拷贝的形式存在的,可以这么说吗?
7楼2011-05-11 21:17:40
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cdl007

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
西瓜(金币+5): Good!很热心! 2011-05-11 00:34:07
friya0910(金币+1): 谢谢 2011-05-11 20:19:02
首先是测序问题,多长的序列有80%的重合?如果800bp以上的序列有80%的重合不能算,因为测序技术所限,800bp以上不准,你需要双向测通,或者多引物重叠测序,然后拼接成一个完整序列

其次有可能是核苷酸多态性的问题,会有一些碱基发生突变,不过,20%的突变率有点高了。。。

再次,你没讲清楚你p的是不是全长,引物是不是有问题,。。。。无序列,无真相
2楼2011-05-11 00:19:10
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friya0910

新虫 (正式写手)

dhd997: 建议引用回复,方便交流 2011-05-11 07:58:40
引物是在cDNA开放阅读框两端设计的,扩增到的片段均为600bp左右,P完以后是两条离得很近的带,一起做切胶回收,然后转化T载体通用引物测序,不存在双向测通问题!还有就是我扩增到的序列在开放阅读框内都含有一段内含子,但内含子长度不一样,去除内含子后推导的氨基酸序列同源性均在90%以上!
3楼2011-05-11 00:30:31
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jhu132llh

荣誉版主 (知名作家)

大洪

引用回帖:
Originally posted by friya0910 at 2011-05-11 00:05:53:
我根据别人的cDNA序列设计引物,在DNA上进行扩增后测序,测得四条不同的序列,核苷酸一致性均在80%以上,那我应该怎么称呼这四条基因呢?我能说我的目的基因在基因组中是以多拷贝的形式存在的吗?百度了一下貌似多 ...

也许有可能是多拷贝基因
青春的岁月,我们身不由己,只因这胸中燃烧的梦想!
4楼2011-05-11 09:02:48
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