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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 什么叫粒子插入法？
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0419xuhao

金虫 (小有名气)

[交流] 什么叫粒子插入法？

大家好，哪位高手能解答下什么是粒子插入法？想用动力学模拟的话该怎么操作？
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1楼 2011-05-10 15:34:25
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御剑江湖

荣誉版主 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 0419xuhao at 2011-05-10 21:04:42:
你好，我就是看到了这篇文献读到的粒子插入法，能否给说明一下这个方法具体怎么操作呢？

关于“粒子插入法”的理解与具体操作，楼主可以见《分子模拟---从算法到应用》第149页，以及楼上的回复。
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5楼2011-05-14 15:12:43
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御剑江湖

荣誉版主 (著名写手)
★ ★ ★ ★
0419xuhao(金币+1):谢谢参与
ghcacj(金币+3, 模拟EPI+1): 谢谢 2011-05-10 18:27:15
引用回帖:
Originally posted by 0419xuhao at 2011-05-10 15:34:25:
大家好，哪位高手能解答下什么是粒子插入法？想用动力学模拟的话该怎么操作？

你是想用分子动力学研究气体分子，才用粒子插入法？


想用动力学模拟的话看我给的文献《分子模拟研究气体在室温离子液体中的溶解度》
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2楼2011-05-10 17:18:45
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0419xuhao

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 御剑江湖 at 2011-05-10 17:18:45:
你是想用分子动力学研究气体分子，才用粒子插入法？


想用动力学模拟的话看我给的文献《分子模拟研究气体在室温离子液体中的溶解度》

你好，我就是看到了这篇文献读到的粒子插入法，能否给说明一下这个方法具体怎么操作呢？
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3楼2011-05-10 21:04:42
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dellus

木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★
0419xuhao(金币+1):谢谢参与
御剑江湖(金币+5): 欢迎常来本版，欢迎回帖 2011-05-12 09:10:12
在采样的时候在体系中随机生成一个粒子3维坐标，计算此时体系（包含新生成的粒子）的能量和原体系的能量之差即deltaU，套用公式计算ex 化学势，然后继续进行模拟，不用记录新粒子坐标
widom insertion是计算化学势比较差的方法，比它好的有Rosenbluth 和 PERM，在Frenkel书上有介绍
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4楼2011-05-12 01:31:09
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