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lpsdu

金虫 (著名写手)

[交流] Gaussian计算的随机性 已有8人参与

同一个版本Gaussian软件,在三台不同的服务器上进行优化计算,同一个输入文件,前27步的能量完全一样,从28步后能量就开始不一样了,难道Gaussian计算也有随机性,请教各位高手是否也遇到类似的问题。
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lpsdu

金虫 (著名写手)


gmy1990(金币+1): 非常感谢你对论坛的贡献,奖励一下! 2011-05-05 20:16:30
谢谢以上各位的讲解,事实上,在一台服务器上能够优化出最终的结构,需要130步,尽管有一个虚频。但在另一台服务器上,优化到41步就停止了,结果出现很多的NaN等错误的信息,最后是Problem with the distance matrix.就停止优化了。这才引起我的注意。我用的Gaussian版本是G03 E.01,以前没有注意过这种情况。只是想测试一下几台服务器的运行速度,才发现这种情况,感觉不应该出现。
7楼2011-05-05 20:12:44
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
gmy1990(金币+1): 非常感谢你对论坛的贡献,奖励一下! 2011-05-05 18:48:21
375642546(金币+3): 2011-05-06 08:58:44
引用回帖:
Originally posted by lpsdu at 2011-05-05 17:41:29:
同一个版本Gaussian软件,在三台不同的服务器上进行优化计算,同一个输入文件,前27步的能量完全一样,从28步后能量就开始不一样了,难道Gaussian计算也有随机性,请教各位高手是否也遇到类似的问题。
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如果是Gaussian09的话,加上一个int=(ultrafine,acc2e=11)试试看,
默认的电子积分收敛标准能保持27步相同已经很不容易了
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
3楼2011-05-05 18:09:50
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by hairan at 2011-05-05 18:09:50:
如果是Gaussian09的话,加上一个int=(ultrafine,acc2e=11)试试看,
默认的电子积分收敛标准能保持27步相同已经很不容易了

老师,您给大家稍稍详细点解释一下吧,虽然内存读取有点差异,但这个差异似乎有点大哦。
前途光明,出路难觅!
4楼2011-05-05 18:13:48
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
gmy1990(金币+1): 非常感谢你对论坛的贡献,奖励一下! 2011-05-05 18:49:10
375642546(金币+3): 给力! 2011-05-06 09:00:36
引用回帖:
Originally posted by lihb734 at 2011-05-05 18:13:48:
老师,您给大家稍稍详细点解释一下吧,虽然内存读取有点差异,但这个差异似乎有点大哦。

我的感觉是类似蝴蝶效应,就是在某一步计算出现了一个看似微不足道的差别,但这种差别不断累积下来最后导致了能量的不尽一致。
不过楼主如果能继续优化完,可能最终的优化结构和总能量也不会有太大差别。

我加的那个关键词是让计算积分时的误差尽量小,看看能不能通过减小一点这方面的误差来保持能量的相同。

另外,总能量的差别还不到0.0001 a.u.,不算很大的差别吧?

[ Last edited by hairan on 2011-5-5 at 18:26 ]
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
5楼2011-05-05 18:25:23
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