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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » Gaussian计算的随机性
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lpsdu

金虫 (著名写手)

[交流] Gaussian计算的随机性已有8人参与

同一个版本Gaussian软件，在三台不同的服务器上进行优化计算，同一个输入文件，前27步的能量完全一样，从28步后能量就开始不一样了，难道Gaussian计算也有随机性，请教各位高手是否也遇到类似的问题。
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1楼2011-05-05 17:41:29
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lpsdu

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by pwzhou at 2011-05-06 13:35:42:
麻烦检查一下机器的内存是否有ECC校验功能，如果没有的话，出现这个很正常。

root命令执行dmidecode | grep ECC看是否有输出。

[ Last edited by pwzhou on 2011-5-6 at 13:51 ]

你好，按照上面的命令输入后，出现以下信息，不知道是不是：

        Error Correction Type: Multi-bit ECC
        Error Correction Type: Single-bit ECC
        Error Correction Type: Single-bit ECC
        Error Correction Type: Single-bit ECC
        Error Correction Type: Single-bit ECC
        Error Correction Type: Single-bit ECC
        Error Correction Type: Single-bit ECC
        Error Correction Type: Single-bit ECC
        Error Correction Type: Single-bit ECC
劳驾给予解释，再次谢谢！
赞一下 回复此楼
12楼2011-05-06 18:49:56
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
gmy1990(金币+1): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-05-05 18:48:21
375642546(金币+3): 2011-05-06 08:58:44
引用回帖:
Originally posted by lpsdu at 2011-05-05 17:41:29:
同一个版本Gaussian软件，在三台不同的服务器上进行优化计算，同一个输入文件，前27步的能量完全一样，从28步后能量就开始不一样了，难道Gaussian计算也有随机性，请教各位高手是否也遇到类似的问题。
20         -2679 ...

如果是Gaussian09的话，加上一个int=(ultrafine,acc2e=11)试试看，
默认的电子积分收敛标准能保持27步相同已经很不容易了
赞一下(3人) 回复此楼
据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
3楼2011-05-05 18:09:50
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by hairan at 2011-05-05 18:09:50:
如果是Gaussian09的话，加上一个int=(ultrafine,acc2e=11)试试看，
默认的电子积分收敛标准能保持27步相同已经很不容易了

老师，您给大家稍稍详细点解释一下吧，虽然内存读取有点差异，但这个差异似乎有点大哦。
赞一下(1人) 回复此楼
前途光明，出路难觅！
4楼2011-05-05 18:13:48
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
gmy1990(金币+1): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-05-05 18:49:10
375642546(金币+3): 给力！ 2011-05-06 09:00:36
引用回帖:
Originally posted by lihb734 at 2011-05-05 18:13:48:
老师，您给大家稍稍详细点解释一下吧，虽然内存读取有点差异，但这个差异似乎有点大哦。

我的感觉是类似蝴蝶效应，就是在某一步计算出现了一个看似微不足道的差别，但这种差别不断累积下来最后导致了能量的不尽一致。
不过楼主如果能继续优化完，可能最终的优化结构和总能量也不会有太大差别。

我加的那个关键词是让计算积分时的误差尽量小，看看能不能通过减小一点这方面的误差来保持能量的相同。

另外，总能量的差别还不到0.0001 a.u.，不算很大的差别吧？

[ Last edited by hairan on 2011-5-5 at 18:26 ]
赞一下(3人) 回复此楼
据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
5楼2011-05-05 18:25:23
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