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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
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nybz1986lizi

铁虫 (小有名气)

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Originally posted by gmy1990 at 2011-05-05 14:22:54:
这个无所谓,这只是一个片段名称而已,这可以随意改,比如改成part1 和 part2 ,主要是相应的原子序号写正确就可以的.

我在提取轨道数据时出现下面的情况:
Starting to analyse the molecular orbitals
Using old output folder
Groups.txt found but not used as logfile does not have atombasis or atomnos
The number of atoms is 32
NBasis is 348
NBsUse is 348
Number of evalues found: 348
Number of orbital symmetries found: 348
To calculate the COOP spectrum, you need Groups.txt and a log file containing a full population analysis

请您指点!谢谢!!
11楼2011-05-06 20:35:28
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gmy1990

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Originally posted by nybz1986lizi at 2011-05-06 20:35:28:
我在提取轨道数据时出现下面的情况:
Starting to analyse the molecular orbitals
Using old output folder
Groups.txt found but not used as logfile does not have atombasis or atomnos
The number o ...

是你的group.txt文件未被识别,格式有问题吗?我发过一个帖子,是关于用gausssum做图的,你可以去看下,http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3129160
12楼2011-05-06 20:39:05
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nybz1986lizi

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by gmy1990 at 2011-05-06 20:39:05:
是你的group.txt文件未被识别,格式有问题吗?我发过一个帖子,是关于用gausssum做图的,你可以去看下,http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3129160

我照你的说明检查了group.txt 没有空行!结果还是出现那个问题!我用的输出文件是test.out难道是一定要将其转换为test.log?  麻烦你了!
13楼2011-05-06 21:04:18
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gmy1990

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
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Originally posted by nybz1986lizi at 2011-05-06 21:04:18:
我照你的说明检查了group.txt 没有空行!结果还是出现那个问题!我用的输出文件是test.out难道是一定要将其转换为test.log?  麻烦你了!

程序已提示,To calculate the COOP spectrum, you need Groups.txt and log file containing a full population analysis,或者你可以试试用这个out文件做其他分析看可不可以,比如先不要group.txt文件,如果不能分析那就是你的out文件有问题,要是能分析那就是你的group.txt文件的问题了,你试试先.

[ Last edited by gmy1990 on 2011-5-6 at 21:32 ]
14楼2011-05-06 21:31:01
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nybz1986lizi

铁虫 (小有名气)

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Originally posted by gmy1990 at 2011-05-06 21:31:01:
程序已提示,To calculate the COOP spectrum, you need Groups.txt and log file containing a full population analysis,或者你可以试试用这个out文件做其他分析看可不可以,比如先不要group.txt文件,如 ...

好的!谢谢解释!
15楼2011-05-06 21:57:14
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474490965

新虫 (小有名气)


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2楼: Originally posted by gmy1990 at 2011-05-03 14:42:49
做个单点能优化,里面有你要的LUMO和HOMO,得到chk文件,转化为fchk文件,再用gaussview做LUMO和HOMO图。
或者你做个布局分析,得到HUMO,cub和LUMO.cub文件,直接用gaussview打开看图。

您好,请问一下cube文件是如何生成的,自己试了一个用g09.读取fchk但是没有弄出来,麻烦您指点一下
16楼2014-03-15 19:01:05
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

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16楼: Originally posted by 474490965 at 2014-03-15 19:01:05
您好,请问一下cube文件是如何生成的,自己试了一个用g09.读取fchk但是没有弄出来,麻烦您指点一下...

用Multiwfn (multiwfn.codeplex.com)载入fch文件,然后用主功能5根据提示操作计算格点数据,在程序里直接就能观看等值面,也可以将数据导出为cube文件。
17楼2014-03-15 21:56:02
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