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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » DL_POLY 算氢键
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paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] DL_POLY 算氢键

现在在做水合物相关问题，水合物由氢键形成。

参考文献也是拿dlpoly算的，得到了漂亮的氢键。我参考文献中的势函数用dlpoly的constrain以及rigid算都没有形成氢键。

有高人用dlpoly算过水的氢键吗？具体怎么操作可以运算得到氢键？
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我是胖人，不是粗人
1楼 2011-04-20 15:57:58
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怜星追月

木虫 (小有名气)
楼主你好！请问你说的参考文献拿dlpoly算后得到了漂亮的氢键，能具体一下是哪篇文献或者能给个文献链接吗？
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倚天照海花无数，流水山高心自如！
4楼2015-09-16 11:43:06
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高学剑

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-04-22 16:19:43
paladinlee(金币+1): 分子动力学模拟氢键的具体力场是什么？别给出简单的SPC，TIP3P，具体点。 2011-04-25 14:44:11
paladinlee(金币+4): 2011-07-13 09:06:50
我是用DL_POLY做水合物的，不过刚刚起步，还不是很明白。爱莫能助！
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2楼2011-04-22 10:36:36
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paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)
分子动力学模拟氢键的具体力场是什么？别给出简单的SPC，TIP3P，具体点。
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我是胖人，不是粗人
3楼2011-04-22 11:11:18
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