24小时热门版块排行榜    

查看: 4018  |  回复: 17
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

hw45888792

金虫 (正式写手)

[求助] siesta计算弱相互作用VDW

siesta trunk版本可以计算两个体系之间的弱相互作用VDW,泛函为

XC.functional VDW
XC.authors DRSLL

    不知道有人用过没?我测试发现,好像需要自己重新做赝势?

read_vps: Pseudopotential generation method:
read_vps: ATM3      Troullier-Martins
Total valence charge:    1.00000

xc_check: Exchange-correlation functional:
xc_check: VDW Dion-Rydberg-Schroeder-Langreth-Lundqvist
xc_check: WARNING: Pseudopotential generated with Ceperley-Alder functional
V l=0 = -2*Zval/r beyond r=  1.2343
V l=1 = -2*Zval/r beyond r=  1.2189
V l=2 = -2*Zval/r beyond r=  1.2189
All V_l potentials equal beyond r=  1.2343
This should be close to max(r_c) in ps generation
All pots = -2*Zval/r beyond r=  1.2343

VLOCAL1: 99.0% of the norm of Vloc inside     28.493 Ry
VLOCAL1: 99.9% of the norm of Vloc inside     64.935 Ry
atom: Maximum radius for 4*pi*r*r*local-pseudopot. charge    1.45251
atom: Maximum radius for r*vlocal+2*Zval:    1.21892
GHOST: No ghost state for L =  0
GHOST: WARNING: Ghost state for L =  1
GHOST: No ghost state for L =  2
KBgen: WARNING: Ghost states have been detected
KBgen: WARNING: Some parameter should be changed in the
KBgen: WARNING: pseudopotential generation procedure.
Stopping Program from Node:    0
p0_20173:  p4_error: : 1

[ Last edited by hw45888792 on 2011-4-20 at 15:03 ]
回复此楼
宠辱不惊,看庭前花开花落;去留无意,望天空云卷云舒。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hw45888792

金虫 (正式写手)

引用回帖:
17楼: Originally posted by smartly at 2012-08-14 15:17:44
各位,我也在用siestavdw计算,当计算si的结构的时候会报如下错误,不知道你们遇到过没有?
Vna:  Cut-off radius for the neutral-atom potential:   9.355120
Vna: WARNING: Cut-off radius for the neutral-ato ...

你的vdW赝势测试过么?
宠辱不惊,看庭前花开花落;去留无意,望天空云卷云舒。
18楼2014-03-04 04:49:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 18 个回答

zhangguangping

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-04-20 21:39:21
hw45888792(金币+10): 2011-05-05 21:45:05
引用回帖:
Originally posted by hw45888792 at 2011-04-20 08:02:38:
siesta trunk版本可以计算两个体系之间的弱相互作用VDW,泛函为

XC.functional VDW
XC.authors DRSLL

    不知道有人用过没?我测试发现,好像需要自己重新做赝势?

read_vps: Pseudopotential generat ...

杨老师的学生胡伟师兄?
我对这个问题不在行。但是好像我听说过一点。
如果是需要改变参数的话,那么你去这个版本的软件包内的atom中看一下,应该这个版本中的atom能够产生VDW的赝势。
弘德明志博学笃行
2楼2011-04-20 16:53:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hw45888792

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2011-04-20 16:53:30:
杨老师的学生胡伟师兄?
我对这个问题不在行。但是好像我听说过一点。
如果是需要改变参数的话,那么你去这个版本的软件包内的atom中看一下,应该这个版本中的atom能够产生VDW的赝势。

恩,我是胡伟,你是?

这个泛函好像不能计算单个水分子,两个水分子就没有问题了,静态计算VDW比PBE总能还要低~

但是优化起来,收敛性好差,不知道是否还需要设置些什么,我也是第一个玩这个,本来打算用VASP做,但是体系有点大,两三百原子,太慢了~

siesta-L里面有人讨论过这个问题,可惜我一直打不开,不爽~
宠辱不惊,看庭前花开花落;去留无意,望天空云卷云舒。
3楼2011-04-20 21:24:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-04-20 21:39:31
引用回帖:
Originally posted by hw45888792 at 2011-04-20 14:24:31:
恩,我是胡伟,你是?

这个泛函好像不能计算单个水分子,两个水分子就没有问题了,静态计算VDW比PBE总能还要低~

但是优化起来,收敛性好差,不知道是否还需要设置些什么,我也是第一个玩这个,本来打算用 ...

我是胡伟的师弟。你如果打不开那个网站,可以搜到了之后,然后用网页代理打开。这个方法准灵。http://www.7daili.com/
我就是这样对付SIESTA-L的以前的邮件的。
弘德明志博学笃行
4楼2011-04-20 21:36:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +5 zju2000 2026-08-16 5/250 2026-08-16 23:23 by Haru815
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +32 医学老男孩 2026-08-13 74/3700 2026-08-16 21:05 by 医学老男孩
[论文投稿] 岩土工程学报什么时候才能终审完呐 25+3 yeager111 2026-08-10 4/200 2026-08-16 20:42 by tfang
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +13 archvillain 2026-08-15 25/1250 2026-08-16 20:13 by zhaosm1982
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +9 Ldrop2023 2026-08-13 9/450 2026-08-16 13:24 by wukun_007
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] filecode +8 cratir 2026-08-14 12/600 2026-08-15 18:08 by zyfgau
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
信息提示
请填处理意见