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黄德青

新虫 (初入文坛)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

good things ,thanks a lots, wish upload many related data!!!
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51楼2011-04-15 11:56:31
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tdong06

木虫 (正式写手)

★★★ 三星级,支持鼓励

那个序列比对也可以在emga中进行的，这样就可以不用那个clustal X。
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52楼2011-04-15 14:24:52
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shenshikang

木虫 (著名写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

强烈建议斑竹给楼主加金币
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53楼2011-04-15 15:30:48
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)
引用回帖:
Originally posted by tdong06 at 2011-04-15 14:24:52:
那个序列比对也可以在emga中进行的，这样就可以不用那个clustal X。

我还没有用过mega做过序列比对呢，试试看。
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54楼2011-04-15 16:58:55
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秋电工

新虫 (小有名气)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

很好，很强大，有天我也能发这么个帖子帮人就美好了
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55楼2011-04-15 20:48:57
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chengang2891

木虫 (小有名气)

★★★ 三星级,支持鼓励

多谢分享
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56楼2011-04-16 10:00:48
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anyghost

禁虫 (初入文坛)
本帖内容被屏蔽
57楼2011-04-16 16:24:36
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hywangwhu

新虫 (小有名气)

★ 一星级,一般

好东东了。
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58楼2011-04-17 09:58:24
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tigerpaw

木虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

必须顶
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59楼2011-04-17 10:45:06
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m2hy

金虫 (正式写手)
太感谢你了，所有想要学习的东东都有了。。。
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60楼2011-04-17 11:25:31
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ling0327

金虫 (小有名气)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

谢谢lz的详细讲解
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61楼2011-04-17 20:50:26
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yzhang_nju

木虫 (正式写手)

★★★ 三星级,支持鼓励

太好了，正需要
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64楼2011-04-18 09:53:02
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ouyangjiexiu

金虫 (小有名气)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

好贴，定期！！！
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65楼2011-04-18 11:31:26
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秋电工

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2011-04-13 00:27:12:
系统发育树的构建及其后期编辑

又到了研究生写毕业论文的时候了，这几天两个师妹相继让我教他们构建系统发育树。索性就做一个图文的帖子，方便大家。纯 ...

弱弱出个声儿，mega4.0中不是嵌合了Clustal了么，为什么我们还要下载一个ClustalX呢？
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66楼2011-04-18 11:36:34
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)
引用回帖:
Originally posted by 秋电工 at 2011-04-18 11:36:34:
弱弱出个声儿，mega4.0中不是嵌合了Clustal了么，为什么我们还要下载一个ClustalX呢？

我没有用过mega中的clustal 哦，呵呵。
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67楼2011-04-18 11:37:58
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mumianke

铁杆木虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

谢谢了。
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68楼2011-04-18 12:36:17
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lovezhjt

铁杆木虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

不错不错！
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69楼2011-04-19 09:59:26
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日中天0

金虫 (小有名气)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

楼主是有心人啊！大定！
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70楼2011-04-19 10:47:30
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haohuang_08

新虫 (初入文坛)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

怎么网页上面的图全挂了呀？一直都想学怎么建树，在网上也找了很多资料看，最终还是以失败告终，今天看到lz的帖子很是不错，顶了，可美中不足的是图挂了，所以可否请lz把上面的发给我。。。不胜感激  haohuang_08@yahoo.com.cn
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71楼2011-04-20 10:44:54
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xiaoli9390

金虫 (初入文坛)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

很好！
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72楼2011-04-20 10:56:41
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lawk00

铜虫 (小有名气)

★★★ 三星级,支持鼓励

虽然自己会这样做，但还是谢谢你的清晰讲解！
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73楼2011-04-20 14:34:11
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)
引用回帖:
Originally posted by haohuang_08 at 2011-04-20 10:44:54:
怎么网页上面的图全挂了呀？一直都想学怎么建树，在网上也找了很多资料看，最终还是以失败告终，今天看到lz的帖子很是不错，顶了，可美中不足的是图挂了，所以可否请lz把上面的发给我。。。不胜感激  [email]ha ...

二楼有PDF下载链接
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74楼2011-04-20 14:41:16
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fudragon

金虫 (小有名气)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

很棒！谢谢楼主。
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75楼2011-04-20 14:52:09
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Alluvion

木虫 (著名写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

谢谢楼主，狠顶~~~~
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77楼2011-04-20 15:42:59
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xiadongliang

金虫 (正式写手)
太麻烦了。
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78楼2011-04-22 10:49:39
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)
引用回帖:
Originally posted by xiadongliang at 2011-04-22 10:49:39:
太麻烦了。

有更简单的方法出现？介绍下啊
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79楼2011-04-22 11:16:43
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xiadongliang

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2011-04-22 11:16:43:
有更简单的方法出现？介绍下啊

直接采用mega 5来做就好了。

导入序列，比对，通过选择NJ算法就直接出结果了。
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80楼2011-04-22 12:01:35
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xiadongliang

金虫 (正式写手)
需要采用gema5建树的，请留下邮箱。
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81楼2011-04-22 12:52:33
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新人小玥

木虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

这个真是个好贴。
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82楼2011-04-22 20:44:49
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annooy

铁虫 (小有名气)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

这个要顶。可以自力更生了
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84楼2011-04-24 11:28:45
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1949stone

荣誉版主 (知名作家)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

★★★★★ 五星级
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85楼2011-04-24 17:23:26
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wanzi

木虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

楼主，牛人啊，这个非常实用
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86楼2011-04-25 09:57:25
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江湖一虫

金虫 (初入文坛)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常好的东西，毫不犹豫的顶~~~
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88楼2011-04-25 13:01:16
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秋电工

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2011-04-13 00:27:12:
系统发育树的构建及其后期编辑

又到了研究生写毕业论文的时候了，这几天两个师妹相继让我教他们构建系统发育树。索性就做一个图文的帖子，方便大家。纯 ...

这个图文并茂的教程早点出现就好了，摸瞎了很久。有几个问题想请教，师兄用的是mega4.0对吧？mega4.0已然嵌有aglin by clustalW，为什么您还要用ClustalX呢？二者有clustal的结果什么区别吗？
另外，如果序列长短不一，可能存在长枝吸引，是不是应该处理下序列（把它们首尾截齐）？师兄可否对这方面进行下补充呢？
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89楼2011-04-26 19:23:32
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秋电工

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2011-04-18 11:37:58:
我没有用过mega中的clustal 哦，呵呵。

嘶。。。继续小白，您这个教程里clustaiX的作用是什么呢？
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90楼2011-04-26 19:25:46
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)
引用回帖:
Originally posted by 秋电工 at 2011-04-26 19:25:46:
嘶。。。继续小白，您这个教程里clustaiX的作用是什么呢？

呵呵，做序列比对的。我没有用过MEGA中的内嵌clustal，因为大多时候我需要导出序列比对的图来说明保守域。

首尾截断我在前面已经提过了，不是必须的。
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91楼2011-04-26 19:39:00
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kwkw

木虫 (著名写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常伟大！
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92楼2011-04-28 08:26:53
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wodsh

铜虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

有一点不明白的，希望楼主能解答：第5步构建NJ树中第三个图里面有original tree和bootstrap consensus tree，到底选哪个比较好呢？谢谢
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97楼2011-05-02 10:14:00
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w319562楼
2011-04-18 08:32   回复  
五星好评  谢谢分享
黄德青63楼
2011-04-18 09:34   回复  
谢谢分享啊！！！
xiezhenrong76楼
2011-04-20 15:08   回复  
五星好评  
cls201083楼
2011-04-23 18:39   回复  
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在雨中87楼
2011-04-25 12:18   回复  
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yhc1234593楼
2011-04-30 23:48   回复  
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九天飞鹰94楼
2011-05-01 09:11   回复  
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ltsos95楼
2011-05-02 08:55   回复  
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wlenglish96楼
2011-05-02 09:24   回复  
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wodsh98楼
2011-05-02 10:27   回复  
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樱桃芳99楼
2011-05-02 22:35   回复  
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xinongfish100楼
2011-05-03 10:05   回复  
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