[交流] 【求助】siesta 做NOSE动力学出错，请高手指教已有4人参与

Originally posted by gavinliu7390 at 2011-04-12 23:19:52:
正常 。   因为你是用热浴的方法加热。
温度本身就是一个统计平均值。  只是长时间的模拟，求平均后才是真实的温度。
一段时间后， 温度的震荡应该逐渐变小。

Originally posted by wangsong1016 at 2011-04-16 22:25:16:
我没有用过nose模块，不过我在用verletMD计算时出现过类似的温度起伏，甚至是剧烈起伏的问题。
    我想可能有如下的原因给你参考。
    首先宏观体系的温度就如二楼所说是个统计平均值，实际上是对分子热运动 ...

Originally posted by wangsong1016 at 2011-05-03 10:34:49:
恒温的动力学过程我没有计算过，所以对过程不太了解。至于10%是否合适我觉得也很难界定，这根据你的体系的大小不同应该是不一样的。体系越小，涨落就越大。计算50个原子时涨落应该大于500个原子，两个体系都用 ...

Originally posted by wangsong1016 at 2011-05-05 09:29:59:
谈不上指教，都是有了问题大家出来一起想办法，以后多交流了。

11楼: Originally posted by zhangguangping at 2011-05-16 00:08:04:
OderN选项，可以查看一下手册上关于OrderN的设置。