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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】新手求助：怎样构造含有三种元素的晶体结构
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pengjiutian

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】新手求助：怎样构造含有三种元素的晶体结构

刚开始学习MS什么都不懂。所以请教各位大侠怎么样构造含有三种元素的晶体结构。例如：



这种化合物怎样构建它的晶体结构啊？？？
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1楼 2011-04-11 14:59:14
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pengjiutian

金虫 (正式写手)
谁能教教我啊！不胜感激啦！！！
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2楼2011-04-11 15:06:52
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)
★ ★ ★
pengjiutian(金币+1): 谢谢您！我试一下啊 2011-04-11 18:01:41
franch(金币+1): 谢谢指点 2011-04-11 20:16:18
franch(金币+2): 谢谢对新虫指点， 2011-04-11 20:18:36
选择新建xsd文件
然后选择build->crystal
然后选择空间群，输入晶格常数
再然后选择add atom，选择元素种类并输入坐标即可
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3楼2011-04-11 17:25:22
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pengjiutian

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2011-04-11 17:25:22:
选择新建xsd文件
然后选择build->crystal
然后选择空间群，输入晶格常数
再然后选择add atom，选择元素种类并输入坐标即可

但是那个N原子和C原子怎么加啊？？
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4楼2011-04-11 18:02:59
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snail594

金虫 (小有名气)
pengjiutian(金币+1): 2011-04-11 20:24:55
add atom
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5楼2011-04-11 18:45:44
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franch

版主 (著名写手)
pengjiutian(金币+1): 2011-04-11 20:25:03
引用回帖:
Originally posted by pengjiutian at 2011-04-11 18:02:59:
但是那个N原子和C原子怎么加啊？？

3楼说的很清楚了，，，楼主不仔细啊，
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6楼2011-04-11 20:19:01
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pengjiutian

金虫 (正式写手)
试了一下，C原子和N原子的位置是一样的。加了C原子后就不能加N原子。这可怎么办啊？？？
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7楼2011-04-12 09:40:35
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ellsaking

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
bingmou(金币+1): 感谢交流！ 2011-04-12 10:21:26
在view--explore里面打开properties，在建立的cell里面你选中你要替换的atom，在properties里面composition里的元素种类换掉
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8楼2011-04-12 09:49:04
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pengjiutian

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by ellsaking at 2011-04-12 09:49:04:
在view--explore里面打开properties，在建立的cell里面你选中你要替换的atom，在properties里面composition里的元素种类换掉

好人哪
我先试试！
回复此楼
9楼2011-04-12 10:11:54
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pengjiutian

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by ellsaking at 2011-04-12 09:49:04:
在view--explore里面打开properties，在建立的cell里面你选中你要替换的atom，在properties里面composition里的元素种类换掉

照着这样做了。但是不知道有没有成功了。用label里面显示elementsymbol好像都是N原子，没有看见C原子。但是计算enegry时得到的答案是这样的：
*******************************************************************************
  

                           -------------------------------
                                      Unit Cell
                           -------------------------------
        Real Lattice(A)                      Reciprocal Lattice(1/A)
   4.9470000   0.0000000   0.0000000        1.2701001   0.0000000   0.0000000
   0.0000000   4.9470000   0.0000000        0.0000000   1.2701001   0.0000000
   0.0000000   0.0000000   3.0360000        0.0000000   0.0000000   2.0695604

                       Lattice parameters(A)       Cell Angles
                    a =    4.947000          alpha =   90.000000
                    b =    4.947000          beta  =   90.000000
                    c =    3.036000          gamma =   90.000000

                       Current cell volume =   74.299448       A**3

                           -------------------------------
                                     Cell Contents
                           -------------------------------
                         Total number of ions in cell =    8
                      Total number of species in cell =    3
                        Max number of any one species =    4

            xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
            x  Element    Atom        Fractional coordinates of atoms  x
            x            Number           u          v          w      x
            x----------------------------------------------------------x
            x  C            1         0.000000   0.000000   0.000000   x
            x  C            2         0.500000   0.500000   0.500000   x
            x  N            1         0.000000   0.000000   0.000000   x
            x  N            2         0.500000   0.500000   0.500000   x
            x  Ti           1         0.304780   0.304780   0.000000   x
            x  Ti           2        -0.304780  -0.304780   0.000000   x
            x  Ti           3         0.195220   0.804780   0.500000   x
            x  Ti           4         0.804780   0.195220   0.500000   x
            xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx

  
        xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
        x  Mixture   Fractional coordinates of atoms  Components  Weights  x
        x   atoms       u          v          w                            x
        x------------------------------------------------------------------x
        x    1        0.000000   0.000000   0.000000   C         0.050000  x
        x                                              N         0.950000  x
        x    2        0.500000   0.500000   0.500000   C         0.050000  x
        x                                              N         0.950000  x
        xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx



                         No user defined ionic velocities

                           -------------------------------
                                   Details of Species
                           -------------------------------

                               Mass of species in AMU
                                    C   12.0109997
                                    N   14.0070000
                                    Ti   47.9000015

                          Electric Quadrupole Moment (Barn)
                                    C    0.0332700 Isotope 11
                                    N    0.0204400 Isotope 14
                                    Ti    0.3020000 Isotope 47

                          Files used for pseudopotentials:
                                    C C_00PBE.usp
                                    N N_00PBE.usp
                                    Ti Ti_00PBE.usp

                           -------------------------------
                              k-Points For BZ Sampling
                           -------------------------------
                       MP grid size for SCF calculation is  5  5  8
                         Number of kpoints used =          24

             +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
             +  Number       Fractional coordinates        Weight  +
             +-----------------------------------------------------+
             +     1   0.400000   0.400000   0.437500   0.0400000  +
             +     2   0.400000   0.400000   0.312500   0.0400000  +
             +     3   0.400000   0.400000   0.187500   0.0400000  +
             +     4   0.400000   0.400000   0.062500   0.0400000  +
             +     5   0.400000   0.200000   0.437500   0.0800000  +
             +     6   0.400000   0.200000   0.312500   0.0800000  +
             +     7   0.400000   0.200000   0.187500   0.0800000  +
             +     8   0.400000   0.200000   0.062500   0.0800000  +
             +     9   0.400000   0.000000   0.437500   0.0400000  +
             +    10   0.400000   0.000000   0.312500   0.0400000  +
             +    11   0.400000   0.000000   0.187500   0.0400000  +
             +    12   0.400000   0.000000   0.062500   0.0400000  +
             +    13   0.200000   0.200000   0.437500   0.0400000  +
             +    14   0.200000   0.200000   0.312500   0.0400000  +
             +    15   0.200000   0.200000   0.187500   0.0400000  +
             +    16   0.200000   0.200000   0.062500   0.0400000  +
             +    17   0.200000   0.000000   0.437500   0.0400000  +
             +    18   0.200000   0.000000   0.312500   0.0400000  +
             +    19   0.200000   0.000000   0.187500   0.0400000  +
             +    20   0.200000   0.000000   0.062500   0.0400000  +
             +    21   0.000000   0.000000   0.437500   0.0100000  +
             +    22   0.000000   0.000000   0.312500   0.0100000  +
             +    23   0.000000   0.000000   0.187500   0.0100000  +
             +    24   0.000000   0.000000   0.062500   0.0100000  +
             +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++

                           -------------------------------
                               Symmetry and Constraints
                           -------------------------------

                      Number of symmetry operations   =          16
         There are no ionic constraints specified or generated for this cell
                      Maximum deviation from symmetry = 0.274614E-15     ANG
               Point group of crystal =    15: D4h, 4/mmm, 4/m 2/m 2/m
           Set iprint > 1 for details on symmetry rotations/translations

                        Centre of mass is NOT constrained

                         Number of cell constraints= 4
                         Cell constraints are:  1 1 3 0 0 0

                         External pressure/stress (GPa)
                          0.00000   0.00000   0.00000
                                    0.00000   0.00000
                                              0.00000
  
+---------------- MEMORY AND SCRATCH DISK ESTIMATES PER NODE -----------------+
|                                                     Memory          Disk    |
| Model and support data                               34.1 MB        31.8 MB |
| Electronic energy minimisation requirements           6.2 MB         3.1 MB |
|                                               ----------------------------- |
| Approx. total storage required per node              40.4 MB        34.9 MB |
|                                                                             |




请问这个到底有没有成功了啊？？？？
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10楼2011-04-12 16:55:39
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ellsaking

金虫 (正式写手)
★ ★
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zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-04-12 20:34:39
从图里面看应该是改好了，你看那个坐标文件，有两个C么
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11楼2011-04-12 19:48:20
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