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汕头大学海洋科学接受调剂
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psfan

铁虫 (正式写手)

[交流] 【求助】求教如何设计gaussian任务体现集群的优势? 已有2人参与

老板最近有意自组小规模集群用于gaussian计算,但顾虑是集群的投入和效率的提升不成比例,于是让我找地方测试一下出个报告,再做决定。
磨了那么长时间终于要迈出这一步了,现在计算环境已经通过私人关系联系好了,可以单独分出几个节点让我做测试,巧的是对方单节点配置和我们的单机配置差不多。

目前的想法是:设计一个适度规模的分子,以几何优化为例,指定不同的节点数目并行计算同一个任务,统计所需的cpu time,出一个报告图,然后决定做多大的集群。

请教这样的设计是否可行?还有没有什么别的方案能充分体现集群的优势?
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psfan

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by pwzhou at 2011-04-08 15:35:40:
你的想法是对的。
可是,Gaussian并行所使用的Linda可是基于TCP的,Gaussian的并行效率恐怕在集群上面体现不出来,你测试一下看看。我估计你节点越多,反而运行的越慢(仅仅猜测,到目前位置我们从来没有尝试去 ...

感谢回复。
3楼2011-04-08 15:55:17
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
375642546(金币+2): 谢谢参与! 2011-04-08 17:44:46
引用回帖:
Originally posted by psfan at 2011-04-08 14:41:35:
老板最近有意自组小规模集群用于gaussian计算,但顾虑是集群的投入和效率的提升不成比例,于是让我找地方测试一下出个报告,再做决定。
磨了那么长时间终于要迈出这一步了,现在计算环境已经通过私人关系联系好了 ...

你的想法是对的。
可是,Gaussian并行所使用的Linda可是基于TCP的,Gaussian的并行效率恐怕在集群上面体现不出来,你测试一下看看。我估计你节点越多,反而运行的越慢(仅仅猜测,到目前位置我们从来没有尝试去使用多节点并行运算Gaussian,03的时候还买了TCP Linda,09我们干脆都没买Linda,直接就是节点内并行的版本,所以给不出Gaussian 09多节点并行的测试数据)
2楼2011-04-08 15:35:40
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