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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 【求助】CIF改错
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ling0302

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】CIF改错

CHECK CIF 后出现了如下错误，不知道如何改正，请大家帮忙提点改正意见啊
谢谢各位了
Alert level A
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D H1WA .. H1WB .. 1.60 Ang.
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D H1WB .. H2WB .. 1.63 Ang.
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1楼 2011-04-04 11:02:59
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king_zhubin

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
10楼: Originally posted by yytsnake at 2012-01-11 19:58:22
一般先用GROW模式，直观地观察该OH周围的环境，从化学的角度判断H原子指向哪个acceptor原子是合理的，然后人为调整该H原子的位置，使其形成合理的H键。这样就不会出现对应的A、B类错误了。It's easy to do that. O ...

请问，如何调整该H原子的位置啊？Fit 之后，refine吗？
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12楼2016-03-02 22:48:50
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272879222

铜虫 (小有名气)
★
nash603(金币+1): 谢谢会提！欢迎常来晶体版！ 2011-04-04 15:35:00
主要是分子间 D-H .. H-D  作用，与放错位置的无序有关
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2楼2011-04-04 11:59:24
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)
★
nash603(金币+1): 谢谢会提！欢迎常来晶体版！ 2011-04-04 15:35:07
如果是O上的H，说明H的位置不合适，需要调整。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-04-04 13:44:37
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ling0302

金虫 (小有名气)
最大残峰好像是游离水，但通过残峰加氢的方法找不到氢，我把残峰数调到100在它的周围也没有出现合理的氢原子
我通过固定加氢的方法加上之后check cif 的时候又出现如上的A类错误，这样的问题用什么方法可以解决啊
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4楼2011-04-05 10:01:03
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