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【求助/交流】急!半定量PCR结果太不稳定
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friend.11
金虫
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虫号: 590424
[交流]
【求助/交流】急!半定量PCR结果太不稳定
我做半定量PCR相看基因表达量的变化趋势,上调、下调或者不变。做半定量PCR做了很久,每一个基因都重复做了好几次,可是结果相当的不稳定,一个基因有时候上调,有时候下调。我都不知道该怎么分析结果。烦哪!!!有没有做过半定量的朋友提供一点经验,帮帮忙啊!
先谢过了!由于之前散尽了金币,现在金币较少,我会逐渐加上去的!请大家帮帮忙!
[
Last edited by friend.11 on 2011-3-31 at 19:57
]
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2011-03-30 20:52:40
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jhu132llh
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friend.11(金币+2): 谢谢! 2011-04-06 10:51:02
看天(金币+2): 鼓励 2011-04-06 12:53:51
引用回帖:
Originally posted by
friend.11
at 2011-03-30 20:52:40:
我做半定量PCR相看基因表达量的变化趋势,上调、下调或者不变。做半定量PCR做了很久,每一个基因都重复做了好几次,可是结果相当的不稳定,一个基因有时候上调,有时候下调。我都不知道该怎么分析结果。烦哪!!! ...
做半定量是很麻烦的事情
首先你得保证每个PCR反应之间的操作手法还有胶什么的没有什么太大的差异的,说白了,就是你的手法首先要稳定;
其次,照胶的影响也是挺大的,因为软件存在一个识别问题;
再次,你做半定量分析的时候,软件的使用也会挺有影响的,同样一块区域,选区大点和小点可能就会有差异,建议手动校正选区。
实在不行,就该定量吧,现在定量试剂盒都很成熟了,并且,定量的数据好发文章
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2011-04-05 17:01:22
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★ ★ ★
lstt09nk(金币+3): 感谢分享经验~ 2011-03-30 22:50:13
friend.11(金币+2): 你说的是定量!不过还是谢谢你! 2011-03-31 19:46:44
我做过Real-time,我的基因每次做都挺稳定,你每次加样,操作都没问题吗?不过我们一个师兄芯片数据,我看有好多基因,三组数据之间结果也不稳定,有的上调,有的下调。我自己觉得这样的话,如果上调下调变化不大,是不是可以说基本上是对你所说的那个因素是不敏感的。它的不稳定只是因为环境或其他因素影响。至少跟那个因素之间没有直接关系,或者有也不是在基因水平,而是蛋白水平了吧。
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2011-03-30 21:07:43
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friend.11(金币+2): 谢谢! 2011-03-31 19:55:28
做real time,重复三次,每次pcr做triplicate。主要看增加倍数和sd,用统计学方法分析差异的显著性。
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2011-03-30 21:17:49
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friend.11(金币+1): 2011-04-03 16:48:24
现在半定量已经很少采用了。如果做半定量,那么起始浓度的标化非常重要。使用的PCR仪要固定,mix要同一批。还是建议用实时定量PCR不会比半定量贵多少,结果还更可靠。
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2011-04-03 16:04:52
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