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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】新手学习siesta，出现错误，现求助
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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qiqi2926

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】新手学习siesta，出现错误，现求助 已有2人参与

背景：（新手，有些关键词的意思不理解）
作cutoff的收敛测试。
脚本如下：
libh4.fdf :
SystemName          libh4
SystemLabel         libh4

NumberOfAtoms       24
NumberOfSpecies     3

%block ChemicalSpeciesLabel
1  1  H
2  3  Li
3  5  B
%endblock ChemicalSpeciesLabel

LatticeConstant     6.4494 5.3070 5.2919  Ang

%block LatticeVectors
      1.000000000000000       0.000000000000000       0.000000000000000
      0.000000000000000       1.000000000000000       0.000000000000000
      0.000000000000000       0.000000000000000       1.000000000000000

%endblock LatticeVectors

AtomicCoordinatesFormat   ScaledCartesian
#ScaledByLatticeVectors

%block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
0.0949999988079071   0.3339999914169312   0.0740000009536743    1    h
0.0949999988079071   0.8339999914169313   0.5740000009536742    1    h
-0.0949999988079071  -0.3339999914169312   0.0740000009536743    1    h
-0.0949999988079071   0.1660000085830689   0.5740000009536743    1    h
0.5949999988079071  -0.3339999914169312   0.0740000009536743    1    h
0.5949999988079071   0.1660000085830688   0.5740000009536743    1    h
0.4050000011920930   0.3339999914169312   0.0740000009536743    1    h
0.4050000011920930   0.8339999914169310   0.5740000009536743    1    h
0.2500000000000000   0.0496999993920326   0.1831000000238419    1    h
0.2500000000000000   0.3510000109672546   0.3802999854087830    1    h
0.2500000000000000   0.5496999993920326   0.6831000000238418    1    h
0.2500000000000000   0.8510000109672545   0.8802999854087830    1    h
-0.2500000000000000  -0.0496999993920326   0.1831000000238419    1    h
-0.2500000000000000  -0.3510000109672546   0.3802999854087830    1    h
-0.2500000000000000   0.4503000006079674   0.6831000000238419    1    h
-0.2500000000000000   0.1489999890327454   0.8802999854087829    1    h
0.0000000000000000   0.0000000000000000   0.0000000000000000    2    li
0.0000000000000000   0.5000000000000000   0.4999999999999999    2    li
0.5000000000000000  -0.0000000000000000  -0.0000000000000000    2    li
0.5000000000000000   0.4999999999999999   0.5000000000000000    2    li
0.2500000000000000   0.2712000012397766   0.1729999929666519    3    b
0.2500000000000000   0.7712000012397767   0.6729999929666518    3    b
-0.2500000000000000  -0.2712000012397766   0.1729999929666519    3    b
-0.2500000000000000   0.2287999987602234   0.6729999929666519    3    b
%endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies


MeshCutoff         40.0 Ry
#%block kgrid-monkhorst-pack
#  9 0 0  0.0
#  0 9 0  0.0
#  0 0 9  0.0
#%endblock kgrid-monkhorst-pack

出现的错误为：
。。。。。。
WARNING: Minimum split_norm parameter:  0.15550. Will not be able to generate orbital with split_norm =  0.15000
See manual for new split options
ERROR STOP from Node:    0
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1楼 2011-03-28 21:23:07
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
sunyang1988(金币+1): 谢谢交流 2011-03-29 00:15:24
引用回帖:
Originally posted by qiqi2926 at 2011-03-28 14:23:07:
背景：（新手，有些关键词的意思不理解）
作cutoff的收敛测试。
脚本如下：
libh4.fdf :
SystemName          libh4
SystemLabel         libh4

NumberOfAtoms       24
NumberOfSpecies     3

%bloc ...

你可以按照提示增大一下，如果再出问题，说明你的编译有问题。我之前遇到过这个问题，是编译的问题。不是设置小的问题。
赞一下(2人) 回复此楼
弘德明志博学笃行
2楼2011-03-28 22:17:51
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qiqi2926

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2011-03-28 22:17:51:
你可以按照提示增大一下，如果再出问题，说明你的编译有问题。我之前遇到过这个问题，是编译的问题。不是设置小的问题。

谢谢，我已经修改过了，没有错误。现在的主要问题是增大这个值会产生什么影响？能不能介绍一点这方面的资料。
PS：正在看 userguide。。
赞一下 回复此楼
3楼2011-03-29 17:08:01
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2): 谢谢分享 2011-03-29 22:31:46
引用回帖:
Originally posted by qiqi2926 at 2011-03-29 10:08:01:
谢谢，我已经修改过了，没有错误。现在的主要问题是增大这个值会产生什么影响？能不能介绍一点这方面的资料。
PS：正在看 userguide。。

看一下手册吧。我也说不清楚。这个参数是价键劈裂的时候，确定第二个zeta占总的波函数的比值。
可以参考一下我给你穿上来的这个附件中的论文。这个是siesta的方法介绍。
赞一下(2人) 回复此楼
弘德明志博学笃行
4楼2011-03-29 20:06:14
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qiqi2926

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2011-03-29 20:06:14:
看一下手册吧。我也说不清楚。这个参数是价键劈裂的时候，确定第二个zeta占总的波函数的比值。
可以参考一下我给你穿上来的这个附件中的论文。这个是siesta的方法介绍。

我将这个参数分别改成0.20和0.25，运行出来的结果也有差异，所以说这个参数并不是无关紧要的。而这两个参数的选取应该有一个优先顺序的，这个顺序应该根据什么量来选择呢，总能，原子间的力，还是其他？？？
    还有就是siesta计算相同体系，得到的总能远大于VASP以及abinit计算出总能的值，这个还是需要您来说明一下。
    最后就是：能不能推荐一些教程或者手册之类的？？user guide给的内容还是有点乱，可能是我还没有适应siesta的文件吧。。。
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5楼2011-03-29 20:51:00
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