应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助成功】split_dos分割DOSCAR的问题
151/1返回列表
查看: 2201  |  回复: 14
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

wujiandongde

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助成功】split_dos分割DOSCAR的问题

各位大侠，有熟悉split_dos的帮帮忙啊，我看了一下split_dos的程序，对于DOS1、DOS2。。。貌似输出的是ene S   Py   Pz ，侯老师的教程里说第一列为能量，第二三四列是s、p、d态的分波态值。小弟糊涂了。。。下面是部分程序：
Atomic projected DOS
            if [ $nspin -eq 2 ]; then
                sed -n ''$start','$end' p' $dosfile | awk '{printf "%12.8f %12.8f %12.8f %12.8f %12.8f %12.8f %12.8f \n", $1+(-1)*'$efermi', $2, -1*$3, $4, -1*$5, $6, -1*$7}' >> DOS$i            else
            sed -n ''$start','$end' p' $dosfile | awk '{printf "%12.8f %12.8f %12.8f %12.8f \n", $1+(-1)*'$efermi', $2, $3, $4 }' >> DOS$i
            fi               

        else
哪位有好用的split_dos，请给我链接或传我一份，多谢！！！

[ Last edited by wujiandongde on 2011-3-24 at 08:56 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-03-23 09:23:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bingmou

金虫 (著名写手)
wujiandongde(金币+2): 2011-03-23 17:48:28
貌似输出的是ene S   Py   Pz

你为什么这么认为呢？
赞一下 回复此楼
2楼2011-03-23 16:46:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ice_rain

铁杆木虫 (正式写手)
★
wujiandongde(金币+2): 2011-03-23 17:47:49
zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-03-24 08:22:26
split_dos 只能输出spd，不能给出分波，所以你用的时候小心，
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-03-23 17:00:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wujiandongde

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2011-03-23 16:46:03:
貌似输出的是ene S   Py   Pz

你为什么这么认为呢？

split_dos程序里有这么一段
sed -n ''$start','$end' p' $dosfile | awk '{printf "%12.8f %12.8f %12.8f %12.8f %12.8f %12.8f %12.8f \n", $1+(-1)*'$efermi', $2, -1*$3, $4, -1*$5, $6, -1*$7}' >> DOS$i
另外，分出来的dos加起来小于总的DOS
赞一下 回复此楼
4楼2011-03-23 17:49:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bingmou

金虫 (著名写手)
★ ★
wujiandongde(金币+2): 2011-03-23 19:10:34
zhang668(金币+2): 多谢指导 2011-03-23 20:34:34
引用回帖:
Originally posted by wujiandongde at 2011-03-23 17:49:44:
split_dos程序里有这么一段
sed -n ''$start','$end' p' $dosfile | awk '{printf "%12.8f %12.8f %12.8f %12.8f %12.8f %12.8f %12.8f \n", $1+(-1)*'$efermi', $2, -1*$3, $4, -1*$5, $6, -1*$7} ...

你应该仔细看看源代码和对应的文件格式。原本的split_dos（我不知道你的从哪里来的，原版的是从vtstscript来的）是没有办法处理Px Py Pz的，只有 s p d f. $2,$3就是s, $4,$5就是p， $6,$7就是d

你可以在版面搜索split_dos，我以前修改过一个版本可以处理分波的

[ Last edited by bingmou on 2011-3-23 at 20:14 ]
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2011-03-23 18:27:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bingmou

金虫 (著名写手)
★
zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-03-24 08:22:43
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2440708&pid=2322307&page=1#pid2322307
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2011-03-23 18:33:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wujiandongde

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2011-03-23 18:33:15:
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2440708&pid=2322307&page=1#pid2322307

多谢高手指点啊！！！
回复此楼
7楼2011-03-23 19:12:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wujiandongde

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2011-03-23 18:33:15:
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2440708&pid=2322307&page=1#pid2322307

您好！那对于LORBIT = 11的DOS来说，是不是分割出来会有19列？
赞一下 回复此楼
8楼2011-03-23 21:06:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bingmou

金虫 (著名写手)
wujiandongde(金币+4): 2011-03-23 21:48:39
是………………
回复此楼
9楼2011-03-23 21:46:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wujiandongde

木虫 (小有名气)
zzy870720z: 如果问题解决，请帮忙把标题求助修改为求助成功，谢谢合作 2011-03-24 08:23:07
引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2011-03-23 21:46:12:
是………………

总算明白了，多谢指点，刚才仔细看看一下你改过的split_dos，我用的lorbit=11所以。。。
赞一下(1人) 回复此楼
10楼2011-03-23 21:48:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wujiandongde

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2011-03-23 18:33:15:
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2440708&pid=2322307&page=1#pid2322307

您好！最近计算DOS又遇到了问题，想请您帮忙了，计算DOS时出现了警告WARNING: stress and forces are not correct
我的INCAR如下：
SYSTEM =
PREC = Normal
ISTART=1
ICHARG=11
ENMAX = 500  ! maximum of ENMAX for B and N
ALGO = Fast  ! electronic relaxation
ISMEAR = -5 ; SIGMA = 0.2  ! Gaussian smearing, -5 for tetrahedron method
IBRION=-1
ISPIN = 2 !magnetic system
LDAU = .TURE.
LDATYPE = 2
LDAUL =-1  2   -1  -1 -1
LDAUU = 0  3    0   0  0
LDAUJ = 0  1    0   0  0
LDAUPRINT = 0

LREAL = Auto ! real space projection for a large system
              ! remove this for an accurate calculation
LORBIT=11
EMIN=-15
EMAX=15
NEDOS=3000
不知道哪里设置的有问题，多谢！
赞一下 回复此楼
11楼2011-04-11 12:18:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bingmou

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by wujiandongde at 2011-04-11 12:18:20:
您好！最近计算DOS又遇到了问题，想请您帮忙了，计算DOS时出现了警告WARNING: stress and forces are not correct
我的INCAR如下：
SYSTEM =
PREC = Normal
ISTART=1
ICHARG=11
ENMAX = 500  ! maxi ...

出了问题请先google。
赞一下 回复此楼
12楼2011-04-11 17:55:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wujiandongde

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2011-04-11 17:55:15:
出了问题请先google。

就是因为没有google到才找高手啊。。。
赞一下 回复此楼
13楼2011-04-11 19:07:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bingmou

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
franch(金币+2): 谢谢指点 2011-04-11 20:19:38
为什么我搜第一个就给出这个呢：
It makes no sense to keep the charge density constant (ICHARG-11)
and relax the ions (ISIF=2, IBRION=1) at one time. Actually, as you set NSW=0,
the positions are not updated anyway, and hence you can ignore that warning.
In your case I would prepare 2 separate INCAR files,
1) for the ionic relaxations (ICHARG not set)
2) for the post-processing after the structure is relaxed (ICHARG=11, NSW=0, but IBRION and ISIF not set )
from：http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp-forum/forum_viewtopic.php?4.714
赞一下(2人) 回复此楼
14楼2011-04-11 20:03:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wujiandongde

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2011-04-11 20:03:41:
为什么我搜第一个就给出这个呢：
It makes no sense to keep the charge density constant (ICHARG-11)
and relax the ions (ISIF=2, IBRION=1) at one time. Actually, as you set NSW=0,
the positions are  ...

多谢了，看来是我没有仔细看这个帖子啊，是可以忽略这个警告的么？多谢指点了！！！
赞一下 回复此楼
15楼2011-04-11 21:19:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wujiandongde 的主题更新
151/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭