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xnbioinfor

铜虫 (小有名气)


[交流] 【求助/交流】做实时定量PCR需要校正内参吗?

实验室的同事做Real-time PCR 之前 都要先做半定量PCR,校正内参,只有内参条带亮度相差无几时才做实时定量, 校正内参有必要吗
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poog502

木虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by 三磷酸腺苷 at 2011-03-26 09:35:44:
如果不是相差特别大,无所谓~~
一般9个数量级以内线性都挺好,如果体系引物各方面没问题

是这样的
7楼2011-03-26 13:52:52
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poog502

木虫 (正式写手)



xnbioinfor(金币+1):谢谢参与
首先没搞明白
既然你半定量就把内参校正好了,好做什么Real-time PCR,直接用半定量的结果就可以说明问题了。
显然,我的做法是首先半定量确定引物的特异性(单一条带,亮)
其次,根据提取RNA的浓度,大致保证反转录后所有的样品浓度较为一致,也可以核酸测定仪准确确定浓度
第三,Real-time PCR后将样品减去内参的Ct值,内参本来就是消除误差的。
2楼2011-03-23 08:21:39
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xnbioinfor

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by poog502 at 2011-03-23 08:21:39:
首先没搞明白
既然你半定量就把内参校正好了,好做什么Real-time PCR,直接用半定量的结果就可以说明问题了。
显然,我的做法是首先半定量确定引物的特异性(单一条带,亮)
其次,根据提取RNA的浓度,大致保证 ...

样品的RNA浓度差异不影响吗
3楼2011-03-25 23:56:45
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xnbioinfor(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by xnbioinfor at 2011-03-25 23:56:45:
样品的RNA浓度差异不影响吗

内参本来就是消除样品量差异的,起始RNA浓度高了,内参信号就强,反之亦然。校正内参没必要。
4楼2011-03-26 00:28:05
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