24小时热门版块排行榜    

查看: 2808  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

7788945

银虫 (小有名气)


[交流] 【求助/交流】RNA质量与qRT-PCR

如图,RNA里有少量基因组DNA残留,这样的RNA如果反转,做定量的话会对结果产生什么样的影响?为了少量的DNA去处理一下担心会出现别的问题。另外有的RNA出现260/230过低的现象,不知道各位大神怎么解决的,请教一下。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
7788945(金币+1): 2011-03-21 19:34:41
设计引物的时候可以跨内含子设计,即:某条引物,其一端在外显子A上,另一端在外显子B上,中间隔一个内含子。这样,基因组DNA是扩增不出来的,只有由剪接过的RNA反转录得到的cDNA才能扩增。如果两条引物都是这样设计,你就不用担心基因组DNA的扩增了。
假如内含子很大的话,还可以这样:5‘端引物在外显子A上,3’端引物在外显子B上,中间隔个内含子。一般qRT-PCR的产物只有几百kb,因此延伸的时间也很短。中间隔个大的内含子,基因组模板相应的产物就很大,PCR程序不利于其扩增。
4楼2011-03-21 18:39:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

houpeichen

新虫 (小有名气)


★
小木虫(沙发+1,金币+0.5):恭喜抢个沙发,再给个红包
7788945(金币+1): 2011-03-21 15:54:14
是植物的RNA吧,可以用DNAaseI处理一下,然后反转录。
2楼2011-03-21 15:43:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

7788945

银虫 (小有名气)


忘了说明了,是植物,前两个是茎的,后两个泳道是叶片
3楼2011-03-21 15:56:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
7788945(金币+3): 2011-03-21 19:40:32
260/230的值,一般不要小于2.0,小的话表明有异硫氰酸胍,β-巯基乙醇或乙醇的残留。补救的方法是再沉淀一次,然后重复乙醇洗涤的过程。但从我的经验看,后面RNA丢得很多……因此提RNA时就注意了:
1.抽提时取上清不要贪多,避免吸到中间层和下层。RNA只要一点点就够做定量了,纯度很重要。我一般400ul上清就取100ul。
2.乙醇洗涤时,尽量让沉淀块整个悬浮起来,这样洗得充分(不要拿枪吹打,RNA沉淀散了就悲剧了……)
3.乙醇洗涤后,尽量吸干(用百枪头),然后让它充分挥发干。都说太干了后面难溶解,但我还没碰到过。看到白色的沉淀块开始变透明就可以加水溶解了。

还有一种原因可能是多糖类杂质残留,可试试用LiCl沉淀。
5楼2011-03-21 18:52:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 极限拉扯,如何抉择 +11 Isak0320 2026-10-12 15/750 2026-10-14 21:55 by 猫鱼不是鱼
[基金申请] 申请科研项目纯靠实力能成功吗? 200+5 David1982 2026-10-13 8/400 2026-10-14 21:38 by lhw_GPA4.0
[硕博家园] 中科院海洋所招收海洋材料相关领域博士研究生及研究助理 +3 sujiner 2026-10-08 4/200 2026-10-14 20:40 by qicaiyun
[职场人生] 40+中年人失业后,还能找到好工作吗? +3 xqy2009 2026-10-13 3/150 2026-10-14 20:17 by 43358052
[论文投稿] 二审4个多月了还是Awaiting Reviewer Scores 10+3 纳斯达克ML 2026-10-11 4/200 2026-10-14 17:30 by babero
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +8 wangyl_123 2026-10-10 13/650 2026-10-14 15:12 by zuesli
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +4 好运来~9527 2026-10-10 7/350 2026-10-13 08:41 by xli1984
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费,对账才发现官费比别人多掏了一倍 +6 13108017953 2026-10-08 6/300 2026-10-12 20:07 by w3w3y3
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些? +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
请填处理意见