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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】CASTEP模块几何优化失败，求解决方案。失败原因详见本帖内容
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chdx0618

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by acridine at 2011-03-24 20:40:07:
楼主莫慌
降低精度之后的这个错误信息出现在什么位置？是一开始计算就出现了，还是在计算了几个能量之后出现的，亦或是在完成了一次scf收敛之后出现的？ 我猜是第三种
能否把错误出现之前的一 ...

你好！看来就是你说的第三种情分况，后半部分文件如下：

  
+---------------- MEMORY AND SCRATCH DISK ESTIMATES PER NODE -----------------+
|                                                     Memory          Disk    |
| Model and support data                              404.4 MB       409.0 MB |
| Electronic energy minimisation requirements         426.3 MB       185.5 MB |
|                                               ----------------------------- |
| Approx. total storage required per node             830.7 MB       594.5 MB |
|                                                                             |
| Requirements will fluctuate during execution and may exceed these estimates |
+-----------------------------------------------------------------------------+
Calculating finite basis set correction with  3 cut-off energies.
Calculating total energy with cut-off of  340.000eV.
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF
SCF loop      Energy           Fermi           Energy gain       Timer   <-- SCF
                               energy          per atom          (sec)   <-- SCF
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF
Initial  -2.43247486E+004  4.83713644E+001                       108.58  <-- SCF
      1  -3.25071705E+004  3.23760606E+000   1.36373699E+002     481.31  <-- SCF
      2  -3.35041494E+004  3.30066966E+000   1.66163142E+001     837.30  <-- SCF
      3  -3.35353740E+004  3.21807494E+000   5.20411473E-001    1129.96  <-- SCF
      4  -3.35170771E+004  1.94314821E+000  -3.04949337E-001    1448.58  <-- SCF
      5  -3.34999662E+004  2.50333578E+000  -2.85182193E-001    1798.88  <-- SCF
      6  -3.34907770E+004  2.51791447E+000  -1.53152541E-001    2164.25  <-- SCF
      7  -3.35587570E+004  1.56213346E+000   1.13300021E+000    2481.02  <-- SCF
      8  -3.34954701E+004  2.89507610E+000  -1.05478204E+000    2822.10  <-- SCF
      9  -3.34838323E+004  2.74292404E+000  -1.93963688E-001    3175.07  <-- SCF
     10  -3.34811649E+004  2.49483488E+000  -4.44560478E-002    3499.60  <-- SCF
     11  -3.34820324E+004  2.45781979E+000   1.44581381E-002    3815.71  <-- SCF
     12  -3.34824619E+004  2.50274836E+000   7.15895446E-003    4134.60  <-- SCF
     13  -3.34829532E+004  2.47632455E+000   8.18691249E-003    4452.47  <-- SCF
     14  -3.34829828E+004  2.46503714E+000   4.94533643E-004    4771.07  <-- SCF
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF

2*Integrated Spin Density   =     41.2082   
2*Integrated |Spin Density| =     44.8577   

Final energy, E             =  -33482.96060955     eV
Final free energy (E-TS)    =  -33482.98282286     eV
(energies not corrected for finite basis set)

NB est. 0K energy (E-0.5TS)      =  -33482.97171620     eV

Calculating total energy with cut-off of  345.000eV.
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF
SCF loop      Energy           Fermi           Energy gain       Timer   <-- SCF
                               energy          per atom          (sec)   <-- SCF
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF
Initial  -3.34773315E+004  2.58332620E+000                      4949.79  <-- SCF
      1  -3.35621441E+004  2.57283318E+000   1.41354302E+000    5252.58  <-- SCF
      2  -3.35622668E+004  2.57253163E+000   2.04620281E-003    5609.02  <-- SCF
      3  -3.38328350E+004  1.50218567E+000   4.50947001E+000    5971.61  <-- SCF
      4  -3.38361142E+004  1.48411522E+000   5.46522223E-002    6295.31  <-- SCF
      5  -3.35750493E+004  2.88090445E+000  -4.35108115E+000    6658.47  <-- SCF
      6  -3.35758944E+004  2.87679861E+000   1.40850889E-002    6945.71  <-- SCF
      7  -3.35073800E+004  2.74869630E+000  -1.14190711E+000    7301.81  <-- SCF
      8  -3.34909281E+004  2.83067048E+000  -2.74198151E-001    7683.81  <-- SCF
      9  -3.34832807E+004  2.37640441E+000  -1.27456432E-001    8042.82  <-- SCF
     10  -3.34782473E+004  2.38656033E+000  -8.38894192E-002    8371.45  <-- SCF
     11  -3.34810172E+004  2.72760682E+000   4.61641968E-002    8696.10  <-- SCF
     12  -3.34780946E+004  2.61682826E+000  -4.87104438E-002    9018.32  <-- SCF
     13  -3.34775561E+004  2.67276882E+000  -8.97462792E-003    9356.19  <-- SCF
     14  -3.34776280E+004  2.68039011E+000   1.19930141E-003    9676.66  <-- SCF
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF

2*Integrated Spin Density   =     22.2209   
2*Integrated |Spin Density| =     27.5608   

Final energy, E             =  -33477.57611971     eV
Final free energy (E-TS)    =  -33477.62803476     eV
(energies not corrected for finite basis set)

NB est. 0K energy (E-0.5TS)      =  -33477.60207723     eV

  
Error in calculate_finite_basis:
     previous calculation had total energy = -33482.98282286      eV
     and this calculation has total energy = -33477.62803476      eV
      => something has gone seriously wrong with minimiser
  
Checkpoint file cannot be written.
Error in calculate_finite_basis: total energies are not variational - aborting
Current trace stack:
calculate_finite_basis_corr
check_elec_ground_state
castep
万望不吝赐教！

[ Last edited by chdx0618 on 2011-3-25 at 15:00 ]
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21楼2011-03-25 14:59:32
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galiha

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我也遇到了此类问题~同求解
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22楼2011-03-25 15:11:45
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acridine

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gzqdyouxia(金币+2): 谢谢提示 2011-03-25 18:33:18
现在的问题应该是：虽然收敛了，但是由于精度低，在进行finite_basis修正的时候Ecut的改变导致能量变化过大，软件判定出现了问题 (当然有问题了: 精度过低)。不过好消息是收敛了，这也是当初选择降低精度的目的。
你现在可以考虑不管finite_basis修正而仅仅考虑低精度的scf计算，利用低精度得到的电子密度作为初试值再进行高精度的计算（castep应该有这个功能吧，你可以在help查一下restart calculation等关键词），这样可能有助于高精度计算时候的收敛。
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23楼2011-03-25 16:45:08
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chdx0618

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by acridine at 2011-03-25 16:45:08:
现在的问题应该是：虽然收敛了，但是由于精度低，在进行finite_basis修正的时候Ecut的改变导致能量变化过大，软件判定出现了问题 (当然有问题了: 精度过低)。不过好消息是收敛了，这也是当初选择降低精度的目的。 ...

专业、高手！我先试试看！
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24楼2011-03-26 09:55:09
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dali2006

木虫 (著名写手)

小木虫酱油店店主
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1): 谢谢建议 2011-03-26 12:09:55
内存溢出的话可以考虑用job control里面的MEMORY模式
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25楼2011-03-26 10:45:57
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awmc2008

至尊木虫 (文坛精英)

学习者
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2): 谢谢建议 2011-03-26 12:10:17
SCF＝200，cut-off energies设大些，Empty bands=44, Runtime optimization: memory。这样计算速度会慢一下。建议增大内存，大于14G。知道计算的体系，才可提进一步的建议。
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xuexizhe
26楼2011-03-26 11:09:48
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chdx0618

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by awmc2008 at 2011-03-26 11:09:48:
SCF＝200，cut-off energies设大些，Empty bands=44, Runtime optimization: memory。这样计算速度会慢一下。建议增大内存，大于14G。知道计算的体系，才可提进一步的建议。

你好！我计算的体系是Ag掺杂LaBaMnO体系，这个体系的掺杂量大约是0.08333（Ag：LBMO），整个体系共60个原子，其中一个La位被Ag替代。
另外电脑的物理内存已不能再增加，两个插槽，每个4G。望不吝赐教！

[ Last edited by chdx0618 on 2011-3-27 at 00:33 ]
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27楼2011-03-26 23:38:12
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zhaojy008

金虫 (小有名气)

彩色风
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
看样子你的CPU没有完全利用起来，可以进行并行计算提高CPU的利用率。或许就能顺利计算了。我以前也碰到过这种情况。
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彩色风
28楼2011-03-27 21:49:27
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chdx0618

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhaojy008 at 2011-03-27 21:49:27:
看样子你的CPU没有完全利用起来，可以进行并行计算提高CPU的利用率。或许就能顺利计算了。我以前也碰到过这种情况。

谢谢！其实CPU的利用率高于50%，那张图是计算刚失败后截的。CPU使用率虽然与计算时相差较大，但内存使用率大致相同。主要关心内存使用情况，还不到3G。
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29楼2011-03-28 09:30:49
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期待和angel

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
我也经常面临着优化失败，尽管精度已经调整得很低
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30楼2011-12-08 10:31:35
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