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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】在构造电极时， 下面这是什么意思？
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qnsyhanjiu

主管区长

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！

[交流] 【求助】在构造电极时， 下面这是什么意思？

# Define the electrode
electrode_Li = PeriodicAtomConfiguration(
    super_cell_vectors=unit_cell,
    elements=4*[Lithium],
    fractional_coordinates=[(0.5, 0.5, float(i)/4.0) for i in range(0,4)]
    )
请问，最后一句是什么意思？
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1楼 2011-03-14 10:56:55
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假如有一天

专家顾问

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
★
qnsyhanjiu(金币+1):谢谢参与
zzy870720z: 希望老兄能在悬赏贴中给出有意义回复，你也不希望在悬赏求助时得到这样的回复吧，谢谢合作 2011-03-14 14:14:50
抢个沙发！
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3楼2011-03-14 11:04:33
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qnsyhanjiu

专家顾问

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
引用回帖:
Originally posted by anjinghebust at 2011-03-14 11:19:12:

我在用ATK做自洽计算的时候，出现的错误如下：怎么解决呀？
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5楼2011-03-21 21:39:02
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acridine

兑换贵宾

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
★ ★ ★
qnsyhanjiu(金币+1):谢谢参与
qnsyhanjiu(金币+5): 谢谢了，我还是解决不了，我猜想事结构的问题，我怎么才能将分子准确的放到电极的中央呀？ 2011-03-21 22:15:10
zhang668(金币+2): 多谢提示 2011-03-26 17:29:42
从编程的角度猜，最后一行的[(0.5, 0.5, float(i)/4.0) for i in range(0,4)]应该就等于
[(0.5, 0.5, 0)(0.5, 0.5, 1/4)(0.5, 0.5, 2/4)(0.5, 0.5, 3/4)]
是四个Li的分数坐标

五楼的错误提示是最大步数已到，但不收敛。
至于原因，只能根据结果自己分析了
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6楼2011-03-21 22:00:43
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acridine

超级版主

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
to楼主： check短消息
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7楼2011-03-21 23:01:56
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anjinghebust

管理员

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
引用回帖:
Originally posted by qnsyhanjiu at 2011-03-21 21:39:02:
我在用ATK做自洽计算的时候，出现的错误如下：怎么解决呀？

很抱歉！专业所限，我没有答案。
祝福问题早日解决!
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8楼2011-03-22 01:00:24
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panjinbo87

专家顾问

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
★
qnsyhanjiu(金币+1):谢谢参与
qnsyhanjiu(金币+5): 你好，在计算透射光谱的时候，是不是系统已经将0点设置为费米点了？怎么才能是图线更加光滑一些呢？ 2011-03-26 19:43:48
如果是08.02我就懂，这个我没用过。
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9楼2011-03-26 16:53:53
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panjinbo87

超级版主

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
★ ★
zzy870720z(金币+2): 谢谢指点 2011-03-27 09:40:15
qnsyhanjiu(金币+13): 怎么将里面的数据导出呀？谢谢了 2011-03-27 12:06:31
是的。EF能设置为0了。把里面数据导出、在origin里面作图，可以调整线条，使得看上去光滑点。
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10楼2011-03-27 08:19:52
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panjinbo87

实习版主

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
mazuju028(金币+1): 谢谢交流 2011-03-27 22:45:05
out文件里面有所有的数据。你要用origin算的话，只能用笨办法，将你想要的东西复制下来。
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11楼2011-03-27 18:02:08
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qnsyhanjiu

实习版主

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
你在计算I-V图线的时候，怎么用来计算多个值呀？谢谢了
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12楼2011-03-27 20:57:29
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panjinbo87

专家顾问

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by qnsyhanjiu at 2011-03-27 20:57:29:
你在计算I-V图线的时候，怎么用来计算多个值呀？谢谢了

你是说计算一个电流值的同时，计算其他的，比如透射谱、MPSH等吧。在nanoscript-analysis-available quantities里面好多选项，都可以选。
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13楼2011-03-28 08:26:35
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qnsyhanjiu

主管区长

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
这是我计算的透射光谱，怎么使其更加光滑呀？
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14楼2011-03-28 09:11:11
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minshiyi

兑换贵宾

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-03-28 21:28:32
引用回帖:
Originally posted by anjinghebust at 2011-03-14 11:19:12:

自洽循环计算超出了设定的最大步数，max_steps  设置大一点
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15楼2011-03-28 18:19:36
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小小中

实习版主

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by qnsyhanjiu at 2011-03-21 21:39:02:
我在用ATK做自洽计算的时候，出现的错误如下：怎么解决呀？

我表示也出现了这个问题 我把最大步数加大了 默认是100 我改成1000了 目前没有结果
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16楼2011-05-22 01:03:09
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qnsyhanjiu

版主

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
引用回帖:
Originally posted by 小小中 at 2011-05-22 01:03:09:
我表示也出现了这个问题 我把最大步数加大了 默认是100 我改成1000了 目前没有结果

100步就够了，如果不自洽，那是你的结构的问题
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17楼2011-05-22 09:54:55
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minshiyi

超级版主

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by qnsyhanjiu at 2011-03-21 21:39:02:
我在用ATK做自洽计算的时候，出现的错误如下：怎么解决呀？

上面不是明明白白写着  自洽循环的步数超出了设定值啊  你自洽循环的步数设定大一些就ok了
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18楼2011-05-23 19:55:10
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minshiyi

管理员

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by qnsyhanjiu at 2011-05-22 09:54:55:
100步就够了，如果不自洽，那是你的结构的问题

有时未必是结构问题   有时atk算某些结构收敛是困难的  我遇到过100步之外收敛的   究竟什么原因  恐怕只有atk的发明人知道
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19楼2011-05-23 19:58:43
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简单回复
yeruoshui2楼
2011-03-14 11:03   回复  
qnsyhanjiu(金币+1):谢谢参与
zzy870720z: 希望老兄能在悬赏贴中给出有意义回复，你也不希望在悬赏求助时得到这样的回复吧，谢谢合作 2011-03-14 14:14:43
anjinghebust4楼
2011-03-14 11:19   回复  
qnsyhanjiu(金币+1):谢谢参与
zzy870720z: 希望老兄能在悬赏贴中给出有意义回复，你也不希望在悬赏求助时得到这样的回复吧，谢谢合作 2011-03-14 14:15:06
qnsyhanjiu(金币+2): 麻烦了，能给解释一下吗 2011-03-14 15:36:30
qnsyhanjiu(金币+20): 麻烦了，我在用ATK做自洽计算时，总是不能自洽？什么原因呀？ 2011-03-21 21:37:33
梦逍遥198920楼
2015-06-22 09:46   回复  
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