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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】求教基因预测及RT-PCR引物设计问题
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游侠892

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】求教基因预测及RT-PCR引物设计问题

我现在通过测序，获得了一段比较长的序列（约40kb）。现在想对这段序列进行基因预测并设计RT-PCR引物，对此段序列中可能的基因表达情况进行分析。
请教高手，我是根据GENSCAN预测到的基因的CDS序列设计RT-PCR引物，还是根据NCBI网站上BLAST 的EST序列设计引物呢？请各位达人能够提供帮忙，谢谢！
PS：希望同时能够给予RT-PCR引物设计的注意事项。
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1楼 2011-03-02 16:13:19
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whtxnn

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
，顶一下，学习学习
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6楼2012-01-05 14:39:21
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游侠892

铁杆木虫 (著名写手)
没人给点建议吗？
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2楼2011-03-04 13:06:41
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sangyu_201

新虫 (小有名气)
游侠892(金币+1): 谢谢~~ 2011-03-05 10:18:33
个人认为还是根据EST序列设计好些，EST 是经过测序后得到的，而预测的是经过软件得到的。
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4楼2011-03-04 16:03:00
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