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【求助/交流】求教基因预测及RT-PCR引物设计问题
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游侠892
铁杆木虫
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虫号: 490693
[交流]
【求助/交流】求教基因预测及RT-PCR引物设计问题
我现在通过测序,获得了一段比较长的序列(约40kb)。现在想对这段序列进行基因预测并设计RT-PCR引物,对此段序列中可能的基因表达情况进行分析。
请教高手,我是根据GENSCAN预测到的基因的CDS序列设计RT-PCR引物,还是根据NCBI网站上BLAST 的EST序列设计引物呢?请各位达人能够提供帮忙,谢谢!
PS:希望同时能够给予RT-PCR引物设计的注意事项。
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1楼
2011-03-02 16:13:19
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whtxnn
新虫
(初入文坛)
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金币: 53
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★
小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖
,顶一下,学习学习
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6楼
2012-01-05 14:39:21
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游侠892
铁杆木虫
(著名写手)
MolEPI: 1
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(小学生)
金币: 8246.4
帖子: 2102
在线: 138.9小时
虫号: 490693
没人给点建议吗?
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2楼
2011-03-04 13:06:41
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sangyu_201
新虫
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应助: 0
(幼儿园)
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帖子: 52
在线: 2.1小时
虫号: 1214452
游侠892(金币+1): 谢谢~~ 2011-03-05 10:18:33
个人认为还是根据EST序列设计好些,EST 是经过测序后得到的,而预测的是经过软件得到的。
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4楼
2011-03-04 16:03:00
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