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游侠892

铁杆木虫 (著名写手)


[交流] 【求助/交流】求教基因预测及RT-PCR引物设计问题

我现在通过测序,获得了一段比较长的序列(约40kb)。现在想对这段序列进行基因预测并设计RT-PCR引物,对此段序列中可能的基因表达情况进行分析。
请教高手,我是根据GENSCAN预测到的基因的CDS序列设计RT-PCR引物,还是根据NCBI网站上BLAST 的EST序列设计引物呢?请各位达人能够提供帮忙,谢谢!
PS:希望同时能够给予RT-PCR引物设计的注意事项。
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游侠892

铁杆木虫 (著名写手)


没人给点建议吗?
2楼2011-03-04 13:06:41
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jiangxue82

木虫 (著名写手)


3楼2011-03-04 13:13:09
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sangyu_201

新虫 (小有名气)


游侠892(金币+1): 谢谢~~ 2011-03-05 10:18:33
个人认为还是根据EST序列设计好些,EST 是经过测序后得到的,而预测的是经过软件得到的。
4楼2011-03-04 16:03:00
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wqj1988926

金虫 (正式写手)


学习一下,帮顶
5楼2011-03-04 16:27:49
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whtxnn

新虫 (初入文坛)


★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
,顶一下,学习学习
6楼2012-01-05 14:39:21
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ncaty

银虫 (小有名气)


怎么没人回复的?
7楼2012-05-08 18:57:04
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