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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】怎么用晶胞和原子坐标等信息写POSCAR
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)
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gzqdyouxia(金币+1): 谢谢交流 2011-02-25 16:52:54
你新建一个txt把那些坐标复制进去，打开excel，文件-打开-，找到那个txt文件，然后导入 选择“分隔符号” 下一步 在“空格”上标记，点击 完成。然后排序，找到最大的位置作为晶格常数a 然后再到空的一行 输入=（前面的列名（其实点击一下就可以了）/a） 回车就行了 复制这个空，选择这一列，黏贴，x坐标就搞定了 y和z的也是这样，熟悉的话不到两分钟能搞定
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
11楼2011-02-25 15:54:17
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zugulitang

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 贺仪 at 2011-02-25 15:54:17:
你新建一个txt把那些坐标复制进去，打开excel，文件-打开-，找到那个txt文件，然后导入 选择“分隔符号” 下一步 在“空格”上标记，点击 完成。然后排序，找到最大的位置作为晶格常数a 然后再到空的一行 输入=（ ...

POSCAR里面的原子坐标等于我现在晶胞中原子的坐标/晶格常数？你是这个意思不？
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12楼2011-02-25 16:07:28
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bingmou

金虫 (著名写手)
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gzqdyouxia(金币+1): 谢谢提示 2011-02-25 20:51:01
引用回帖:
Originally posted by zugulitang at 2011-02-25 16:07:28:
POSCAR里面的原子坐标等于我现在晶胞中原子的坐标/晶格常数？你是这个意思不？

由于你的三个基矢是相互垂直的，所以这么做也是可以的。另外，你没有用过VASP吗？如果没有估计一时半会还不会很顺利
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13楼2011-02-25 16:59:09
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zugulitang

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2011-02-25 16:59:09:
由于你的三个基矢是相互垂直的，所以这么做也是可以的。另外，你没有用过VASP吗？如果没有估计一时半会还不会很顺利

学过一点，算过几个，但是不怎么会，算是能算，但是算后的结果也不知怎么处理，有什么好的资料可以介绍吗？除了侯柱锋的书，他的看了，但是感觉还是不能真正领悟。
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14楼2011-02-25 17:13:11
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zugulitang

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2011-02-25 16:59:09:
由于你的三个基矢是相互垂直的，所以这么做也是可以的。另外，你没有用过VASP吗？如果没有估计一时半会还不会很顺利

POSCAR可否如下写？
Zr26Cu17Al5
1.0
6.483954  0       0
0     6.483954   0
0      0      22.516254
26 17 5
Cartesian
  -1.000000       -1.000000       -0.666700       0.5000
   -0.500000       -0.500000       -0.166700       0.5000
  -1.000000       -1.000000       -0.333300       0.5000
。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。
有没有高手给我示范下啊，谢谢了。
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15楼2011-02-25 18:08:43
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bingmou

金虫 (著名写手)
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sunyang1988(金币+1): 谢谢交流 2011-02-26 10:59:41
引用回帖:
Originally posted by zugulitang at 2011-02-25 18:08:43:
POSCAR可否如下写？
Zr26Cu17Al5
1.0
6.483954  0       0
0     6.483954   0
0      0      22.516254
26 17 5
Cartesian
  -1.000000       -1.000000       -0.666700       0.5000
   -0.500000  ...

Cart改为Direct.最后 那一个列0.5000是什么？不要跟我说是四指数坐标啊？
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16楼2011-02-25 18:18:56
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zugulitang

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2011-02-25 18:18:56:
Cart改为Direct.最后 那一个列0.5000是什么？不要跟我说是四指数坐标啊？

不好意思，是我自己搞错了，那一列是不需要的，那如果我要用卡迪尔（Cartesian）坐标系来表示呢？也就是按我之前的Cartesian，那么原子坐标应该怎么表示呢？另，如果缩放系数，也就是晶格常数（我上面所写POSCAR的第二行）不为1，取三个晶胞边长中最大的应该怎么写？是否可以如下所写Zr26Cu17Al5
22.516254
0.287968  0       0
0     0.2879680
0      0      1
26 17 5
Direct
  -1.000000       -1.000000       -1.000000      
-0.500000       -0.500000       -0.500000      
-1.000000       -1.000000       -0.666700      
-0.500000       -0.500000       -0.166700      
-1.000000       -1.000000       -0.333300      
-0.500000       -0.500000       -0.833300
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17楼2011-02-25 19:24:57
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bingmou

金虫 (著名写手)
★
sunyang1988(金币+1): 谢谢交流 2011-02-26 10:59:53
引用回帖:
Originally posted by zugulitang at 2011-02-25 19:24:57:
不好意思，是我自己搞错了，那一列是不需要的，那如果我要用卡迪尔（Cartesian）坐标系来表示呢？也就是按我之前的Cartesian，那么原子坐标应该怎么表示呢？另，如果缩放系数，也就是晶格常数（我上面所写POSCA ...

可以这么写
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18楼2011-02-25 22:28:33
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hakuna

木虫 (知名作家)
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
sunyang1988(金币+1): 谢谢交流 2011-02-26 11:00:07
坐标、晶胞参数你都有了，按VASP格式真理一下就OK了
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19楼2011-02-26 09:16:34
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zugulitang

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2011-02-25 22:28:33:
可以这么写

我那个Direct下面的坐标是对的吗？因为我看侯柱锋的书上说“Direct模式时坐标以晶胞基矢为单位，卡迪尔（Cartesian）坐标系给出的是原子的绝对坐标”，这句话是什么意思呢？我对自己写的都不是很理解，总觉得是错的，请高手们指点，谢谢了！
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20楼2011-02-26 10:04:37
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