24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 957  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

mandy33

银虫 (初入文坛)


[交流] 【求助/交流】求助关于基因序列的变异分析用什么软件?

请教大家一个问题?
有谁知道基因序列的功能性分析用什么软件分析吗?比如一段基因序列,要分析出它包括不包括CArGboxes,Y boxes or TATAbox 怎么分析?用什么软件?请高人指点一下啊?急啊,谢谢各位啦!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mandy33

银虫 (初入文坛)



。我现在已经克隆出一段基因序列,想对3’UTR  U3区转录调控元件进行分析,如C/EBP黏着位点,CArGbox、Ybox、PREbox、TATAbox等保守性。但不知道用什么软件分析U3区 C/EBP黏着位点,CArGbox、Ybox、PREbox、TATAbox等以及它们的保守性如何。 那位高人指点一下啊,说得具体点啊,谢谢啦!
6楼2011-02-22 14:52:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

xmy0523

新虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+3): 很活跃,欢迎常来交流 2011-02-20 14:54:45
1949stone(金币+1): 鼓励交流 2011-02-20 14:55:57
1949stone(金币+1): 鼓励交流 2011-02-20 14:56:09
mandy33(金币+1): 2011-02-22 14:46:30

我觉得的用Bowtie就行吧,把你要的那几段序列写进去,一运行就出来了。http://bowtie-bio.sourceforge.net/index.shtml  当然很多其他的程序也应该可以。
2楼2011-02-20 14:47:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xmy0523

新虫 (小有名气)



1949stone(金币+1): 鼓励交流 2011-02-20 14:56:06

还有,可以上NCBI去检索一下,用blast或者genbank。
3楼2011-02-20 14:48:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xmy0523

新虫 (小有名气)



rainwander(金币+1): 鼓励积极参与交流~~~ 2011-02-20 23:07:01
mandy33(金币+1): 2011-02-22 14:46:40
4楼2011-02-20 14:56:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 求调剂 有机化学考研356分 +11 Nadiums 2026-03-25 12/600 2026-03-31 18:24 by oooqiao
[考研] 284求调剂 +9 小熊~~ 2026-03-31 9/450 2026-03-31 18:22 by 253863592
[考研] 336材料求调剂 +10 陈滢莹 2026-03-26 12/600 2026-03-31 17:59 by jp9609
[考研] 322求调剂 +3 熹僖XX 2026-03-31 3/150 2026-03-31 16:32 by 记事本2026
[考研] 271求调剂 +5 勒布朗@ 2026-03-31 7/350 2026-03-31 16:26 by hypershenger
[考研] 343求调剂 +8 爱羁绊 2026-03-28 8/400 2026-03-31 16:12 by 不吃魚的貓
[考研] 英一数一总分334求调剂 +4 陈阳坤 2026-03-31 4/200 2026-03-31 14:22 by 记事本2026
[考研] 085600 295分求调剂 +13 W55j 2026-03-30 15/750 2026-03-31 13:29 by 王亮_大连医科大
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +4 崔wj 2026-03-31 4/200 2026-03-31 11:56 by jp9609
[考研] 262求调剂 +7 ZZ..000 2026-03-30 8/400 2026-03-31 10:05 by cal0306
[考研] 求调剂 +4 研s. 2026-03-25 4/200 2026-03-31 10:05 by fmesaito
[考研] 08工科,295,接受跨专业调剂 +6 lmnlzy 2026-03-30 6/300 2026-03-31 10:04 by cal0306
[考研] 一志愿中海洋320化学工程与技术学硕求调剂 +8 披星河 2026-03-30 8/400 2026-03-31 08:53 by lbsjt
[考研] 材料与化工调剂一志愿大连海事085600,349 +6 吃的不少 2026-03-30 6/300 2026-03-31 04:17 by fmesaito
[考研] 298求调剂 +3 什么是胖头鱼 2026-03-30 5/250 2026-03-30 14:41 by 青海小西牛
[考研] 环境科学与工程334分求调剂 +6 王一一依依 2026-03-30 8/400 2026-03-30 11:52 by yjolah
[考研] 086000生物与医药调剂 +5 Feisty。 2026-03-28 9/450 2026-03-29 12:02 by longlotian
[考研] 343求调剂 +6 爱羁绊 2026-03-29 6/300 2026-03-29 12:00 by 无际的草原
[考研] 312,生物学求调剂 +3 小译同学abc 2026-03-28 3/150 2026-03-28 15:32 by 落睿可思
[考研] 调剂 +4 柚柚yoyo 2026-03-26 4/200 2026-03-26 20:43 by fmesaito
信息提示
请填处理意见