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[交流] 【求助】DLPOLY计算出来的结果，是否要编程才能分析？

计算出来的HISTORY文件，要怎么才能得到RDF,MSD等信息？

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1楼 2011-01-12 15:57:55

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winterz

木虫 (小有名气)

模拟EPI: 1
应助: 0 (幼儿园)
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+10):谢谢 2011-01-13 11:43:23

引用回帖:

Originally posted by zyj8119 at 2011-01-12 23:10:11:

终于把msdprg.f编译成了msdprg.exe,然后把HISTORY拷贝到一起，运行
./msdprg.exe

不要把HISTORY改名，要重新编辑一个msd_input文件，按照msdprg.f里要求的格式和你模拟所设置的参数输入变量：

=======================================================================
c    read the control variables

c    name of atomic species for autocorrelation
   read(5,*)atname

c    name of selected HISTORY file
   read(5,*)fname

c    HISTORY file formatted or unformatted
   read(5,*)fmt

c    total number of atoms in a HISTORY file configuration
   read(5,*)natms

c    time interval between successive configurations
   read(5,*)tstep

c    max number of configurations to sample
   read(5,*)nconf

c    working length of msd array
   read(5,*)nmsd

c    sampling interval
   read(5,*)isampl

c    interval between origins
   read(5,*)iomsd

c    average cell vectors (taken from dl_poly OUTPUT file)
   read(5,*)avcell
=========================================================================

然后直接执行./msdprg.exe，会生成一个msd_output

以下是一个msd_input样例

=========================================================================
C
HISTORY
formatted
720
1.0
5000
500
10
1
25.345 0.00 0.00
  0.00  25.345 0.00
  0.00 0.00  25.345
=========================================================================