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【求助】DLPOLY计算出来的结果,是否要编程才能分析?
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zyj8119
木虫
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【求助】DLPOLY计算出来的结果,是否要编程才能分析?
计算出来的HISTORY文件,要怎么才能得到RDF,MSD等信息?
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2011-01-12 15:57:55
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zyj8119
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Originally posted by
043114076
at 2011-01-12 21:46:12:
记得好像是写原子名,你可以看一下vmd的说明书,或者自己试试
说明书写的不清楚,我先mouse->label->atoms,然后graphics->labels->貌似什么用也没有。
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12楼
2011-01-12 22:30:15
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043114076
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zyj8119(金币
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):谢谢参与
zyj8119(金币+10):应该怎么做呢? 2011-01-12 19:56:11
ghcacj(金币+1):谢谢 2011-01-13 11:43:50
vmd 自身带的分析功能可以实现
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2011-01-12 16:47:18
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winterz
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zyj8119(金币
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zyj8119(金币+18):谢谢兄弟。。 2011-01-12 19:36:41
ghcacj(金币+3):谢谢 2011-01-13 11:43:57
引用回帖:
Originally posted by
zyj8119
at 2011-01-12 15:57:55:
计算出来的HISTORY文件,要怎么才能得到RDF,MSD等信息?
MSD使用自带的Java GUI和msdprg.f都可以计算。
RDF只要在CONTROL文件中写入以下两行,就会生成一个RDFDAT文件,里面是各原子RDF信息。
rdf 100
print rdf
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3楼
2011-01-12 19:27:24
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zyj8119
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Originally posted by
043114076
at 2011-01-12 16:47:18:
vmd 自身带的分析功能可以实现
VMD应该怎么做?RDF和MSD都能分析吗?
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4楼
2011-01-12 19:37:32
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