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asdfghjkl-00

新虫 (初入文坛)


[交流] 【求助/交流】求助DGGE的问题

我做了一次DGGE,条带是有的,但是跑的不是开,请问 是什么原因?有什么解决办法?
电压时60V ,时间是12h,梯度是30%-70%

[ Last edited by asdfghjkl-00 on 2011-1-11 at 09:58 ]
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rainwander

铁杆木虫 (知名作家)


★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
dhd997(金币+1):说的是啊 2011-01-12 10:02:57
先做个垂直电泳,摸索一下最适梯度吧
2楼2011-01-11 10:38:17
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suoyi001

铜虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
dhd997(金币+5):鼓励新虫交流 2011-01-11 14:08:53
asdfghjkl-00(金币+1): 2011-01-12 09:15:35
梯度不够啊,建议跑个梯度,跑的时间12h,有些长吧,我们都是4h。看看会不会是染色时间不够啊。
3楼2011-01-11 13:43:25
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在雨中

金虫 (著名写手)


★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
asdfghjkl-00(金币+1): 2011-01-12 09:14:49
dhd997(金币+1):鼓励交流 2011-01-12 10:03:10
我如果是120V,才跑12h的,难道你的电泳时间不够?很有可能!
4楼2011-01-11 16:11:08
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hfkset

铜虫 (初入文坛)


不懂,学习一下
5楼2011-01-11 17:08:37
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孟孟525

铁虫 (正式写手)


★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
dhd997(金币+1):恩,没错 2011-01-12 10:03:24
DGGE需要预先摸索条件的 时间电压 变性剂的浓度都很重要
6楼2011-01-11 21:16:48
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asdfghjkl-00

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
Originally posted by suoyi001 at 2011-01-11 13:43:25:
梯度不够啊,建议跑个梯度,跑的时间12h,有些长吧,我们都是4h。看看会不会是染色时间不够啊。

电压不大,所以跑的长,染色用的是EB,时间是20分钟,我也觉得是梯度的问题
7楼2011-01-12 09:10:41
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asdfghjkl-00

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
Originally posted by 在雨中 at 2011-01-11 16:11:08:
我如果是120V,才跑12h的,难道你的电泳时间不够?很有可能!

有的条带已经跑到下边了,我怕再跑就出去了,所以想调整一下梯度,看是否可行?
8楼2011-01-12 09:13:13
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在雨中

金虫 (著名写手)


★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
rainwander(金币+2):很有经验啊~~~鼓励积极参与交流~~~ 2011-01-12 10:29:31
引用回帖:
Originally posted by asdfghjkl-00 at 2011-01-12 09:13:13:

有的条带已经跑到下边了,我怕再跑就出去了,所以想调整一下梯度,看是否可行?

你范了一个严重的概念错误。如果梯度合适,电泳时间再长DNA也不会跑出去的,因为DNA在它最合适的地方解链,迁移率非常低。
你的是不是细菌的DGGE?V3区的,这个梯度比较合适了。
真菌的话,大概20-50%的梯度。

你可以把你的上梯度弄大些,比如40-70%,但电泳时间要足够。我做的话,一般100-120V,12h。效果很好。
9楼2011-01-12 10:13:08
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asdfghjkl-00

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
Originally posted by 在雨中 at 2011-01-12 10:13:08:


你范了一个严重的概念错误。如果梯度合适,电泳时间再长DNA也不会跑出去的,因为DNA在它最合适的地方解链,迁移率非常低。
你的是不是细菌的DGGE?V3区的,这个梯度比较合适了。
真菌的话,大概20-50%的梯度 ...

恩,好的,谢谢!
10楼2011-01-12 11:28:25
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