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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】用DS优化后的分子和pipeline pilot优化后的分子的RS构型问题
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ts2009

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】用DS优化后的分子和pipeline pilot优化后的分子的RS构型问题

目前手上有个数据库，里面包括100万个分子，由于数据库太大，故一次性用DS优化有着很大困难，故自己想要pipeline pilot做个管道，进行处理.但是要保证pipeline pilot优化后的分子和直接用DS优化产生的准确的分子RS构型。
在数据库中抽取10个分子用自己编的管道如下图所示

运行后发现分子的RS构型与直接用DS加氢，几何优化的RS构型不同，请高手告知原因或者有很么好的办法，望不吝赐教。能解决问题的或是给点想法的必当BB重谢，
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1楼 2011-01-08 21:22:22
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我不是陈冠希

铜虫 (小有名气)
★
ts2009(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币-2):请不要在多个帖子中发布这种无意义的回复，扣2金币以警示 2011-01-10 23:25:32
不太清楚噢
本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2386813&fpage=1
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6楼2011-01-10 22:23:21
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myputer

铜虫 (初入文坛)

没有尝试过，也没有遇到这种情况，无能为力

★
ts2009(金币+1):谢谢参与
没有尝试过，也没有遇到这种情况，无能为力，，还有，小弟在电驴下的DS，怎么一直破解不好，DS BLAST用不了，请问是什么情况，或是告诉我下载个好用点的
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-01-08 22:25:45
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ts2009

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by myputer at 2011-01-08 22:25:45:
没有尝试过，也没有遇到这种情况，无能为力，，还有，小弟在电驴下的DS，怎么一直破解不好，DS BLAST用不了，请问是什么情况，或是告诉我下载个好用点的

网上有很多破解版的可以用，建议加个DS交流的群，里面有人上传好破解的DS，可以用的，不过发PAPER还是要有正版的授权软件单位的，祝好运
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3楼2011-01-09 08:50:54
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myputer

铜虫 (初入文坛)

还是没有搞定

还是没有搞定，加了个群，没人帮我，呵呵，，，你方便的话帮我一下吧，谢谢
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4楼2011-01-09 16:05:23
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