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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【讨论】用MOE做分子对接
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sandy1233

金虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】用MOE做分子对接 已有7人参与

用MOE做分子对接，打分为多少分时可以认为配体和受体有相互作用呐？
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1楼 2011-01-04 10:43:18
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sandy1233

金虫 (小有名气)
有没有做MOE的，指导一下偶啊。
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2楼2011-01-05 21:13:27
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ts2009

木虫 (著名写手)

无业游民
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-01-17 21:57:31
自己看看相关的MOE的介绍，上面有关于相关分子对接的介绍，要多看书。有相互作用，只要打分不是0都可认为有作用，针对不同的配体受体相互作用，具体情况具体分析
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√：寂寞无边蔓延,触到无边伤感!
3楼2011-01-17 13:22:35
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lin_lin_lin

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-04-28 17:25:36
MOE 有多种打分方式的。你选的哪一种，比如有的直接算结合自由能，但是算法方程不一样，所以不知道你用那种打分方式。比如LONDEN dG ，就是结合自由能，在help文档可以看到方程。单位一般是KJ/MOL 可以换算成结合的IC 50值。
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4楼2012-04-28 15:36:47
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Dionysius

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
找一个阳性化合物做参考
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5楼2012-05-02 16:29:42
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wwb168

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
一般不用MOE做对接，对接出来的结果不理想
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6楼2012-05-09 09:39:08
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cpuzzx

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
1963675楼: Originally posted by lin_lin_lin at 2012-04-28 15:36:47
MOE 有多种打分方式的。你选的哪一种，比如有的直接算结合自由能，但是算法方程不一样，所以不知道你用那种打分方式。比如LONDEN dG ，就是结合自由能，在help文档可以看到方程。单位一般是KJ/MOL 可以换算成结合的 ...

请问怎么换算成IC50？
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7楼2012-10-31 15:18:55
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mrasiprin

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by ts2009 at 2011-01-17 13:22:35
自己看看相关的MOE的介绍，上面有关于相关分子对接的介绍，要多看书。有相互作用，只要打分不是0都可认为有作用，针对不同的配体受体相互作用，具体情况具体分析

关于MOE有什么参考书籍可以推荐一下吗？谢谢
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8楼2018-12-17 15:59:57
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