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木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】为什么RCSB里面查询一个蛋白的结构会有很多有个呢？已有3人参与

如题，这个序列不是唯一的吗？

1楼2010-12-27 18:46:21

银虫 (初入文坛)

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scelab(金币+3):热心虫友，欢迎多来交流~~~:tiger06::tiger28::tiger23: 2010-12-27 23:22:51

你说的是PDB库吗？因为有不同的课题组做的蛋白，而且往往不同课题组可能得到了很好活性的化合物，想看看他们之间的结合模式，都会做一个蛋白结构出来，所以一个蛋白有很多结构是很正常的。往往由于契导诱合的存在，在活性口袋部位的残基位置会略有不同的。

2楼2010-12-27 22:15:29

银虫 (初入文坛)

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引用回帖:

Originally posted by liuliang_045 at 2010-12-28 08:57:17:
我是查的PDB库呢，我看有两个很接近，就是氨基酸数目不一样，那这样子的话，我是不是参考哪一个都可以呢？或者说两者的差别不算是太大呢？

氨基酸数目不一样的大吗？你需要的domain处的氨基酸差别大吗？不同的组解晶体的时候，有的loop会缺失氨基酸残基的。
参考那个还是要看实际情况，你需要的部分解得好不好，还有就是分辨率啊什么的，就是晶体学上的一些指标，还有就是一般越新的结构会越好一点。还是要看具体的问题，自己多分析一下

5楼2010-12-28 09:31:03

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