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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】小弟对启动子序列的确定有惑，望解惑。
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feiye2214

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】小弟对启动子序列的确定有惑，望解惑。

是不是有软件能预测分析启动子序列？

我现在已经P出来了一段800bp的基因序列了，BLAST之后同源性还是很好的（94%），我最紧迫的任务是克隆这个基因的启动子片段（cDNA不是首要任务），有Genome Walking Kit，染色体步移几次，应该能搞到上游10kb吧，就可以把启动子区域囊括进去了，问题来了，怎么确定从哪到哪是启动子序列？

听说有软件能预测分析启动子序列？真的有么？准确性如何？

[ Last edited by feiye2214 on 2010-12-26 at 22:51 ]
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1楼 2010-12-26 20:36:24
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feiye2214

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by magy2006 at 2010-12-27 10:04:11:
你先把完整的CDNA区域拿到，然后，可以通过试剂盒取得5K以上区域的启动子区域，能获得这么长基本上就差不多了，然后通过软件分析，就可以知道那是启动子区域，那是UTR区域，给你两个网站，对分析启动子有用的：[u ...

高手，谢谢你
在线预测不能精确到每个碱基，是不是还需要自己通过其他方式协助，才能搞定所有的碱基哈？
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8楼2010-12-27 10:46:59
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feiye2214

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by feiye2214 at 2010-12-26 20:36:24:
是不是有软件能预测分析启动子序列？

我现在已经P出来了一段800bp的基因序列了，BLAST之后同源性还是很好的（94%），我最紧迫的任务是克隆这个基因的启动子片段（cDNA不是首要任务），有Genome Walking Kit，染 ...

给自己顶下啦
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2楼2010-12-26 22:52:18
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dhd997

荣誉版主 (文坛精英)
帮你高亮一下，希望尽快有人答复你
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3楼2010-12-27 08:46:04
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zhangjin2010

木虫 (著名写手)
不知道哦！祝福你了！
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4楼2010-12-27 09:00:19
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