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【求助/交流】荧光定量pcr求助
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lianyi1989
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[交流]
【求助/交流】荧光定量pcr求助
最近刚刚做荧光定量,但是结果总是不好,有一点就是老达不到平台期,已经40个循环了,模板量已经加到2ul(20ul体系),但还是不行,不知道是为什么,达不到平台期出来模板量低不知道还有没有其他原因?请各位能帮忙分析下,谢了!
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2010-12-23 14:58:18
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lovenlong
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好似你的体系有问题哦!
lianyi1989(金币+1): 2010-12-28 10:56:23
1.楼主的体系用的模板量是多少?各个反应管是否一致?按照标准的PCR体系来配,同时结合你用的试剂说明书来配体系,一般不会有太大问题。我做的10微升的体系一般10~30ng的模板就够了。
2.达不到平台期,有时候很难讲清楚原因的。可能你同样的体系有时能行有时又不行,细节不好把握。我上个月58度退火做得很好,昨天就不行了,今天换57度退火做了两次,第二次才行,不知道为啥。
3.最好是先做个梯度摸一摸退火温度,不然就来个Touch Down吧。个人感觉退火温度经常是没P好的主要原因。至于镁离子什么的定量可以少去考虑。
4.先配反应母液再分装,做三个以上重复测试体系可能会对你的实验有好处,特别是你以后做着做着老出问题的时候很烦的。
补充:如果PCR达不到平台期,定量结果很难看的,基本上没用。。。
[
Last edited by lovenlong on 2010-12-27 at 14:37
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2010-12-27 14:36:22
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lianyi1989(金币+1): 2010-12-23 19:33:35
上图呗,还有,为什么非得到平台,只要有平台的趋势就可以了
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2楼
2010-12-23 16:52:56
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★
rainwander(金币+1):鼓励积极参与~~~ 2010-12-23 18:54:35
lianyi1989(金币+1): 2010-12-23 19:33:40
我曾经碰到过类似的问题。
如果你的模板没有问题的话,是不是可以考虑下你的PCR mix的质量。
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3楼
2010-12-23 18:28:23
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Originally posted by
love_st
at 2010-12-23 16:52:56:
上图呗,还有,为什么非得到平台,只要有平台的趋势就可以了
就是到最后指数期还没完呢~这结果肯定没法用啊
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4楼
2010-12-23 19:33:25
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dashu-97332
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2010-12-23 21:04
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