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【求助】做NAMD的1K4C.pdb时候出现的错误
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我已经按照membrane proteins tutorial做出了KCSA.pdb文件，但是在实行tcl语句：foreach S{A B C D}{set seg [atomselect top "segname $S and chain C"]$seg writepdb seg$S.pdb $seg delete的时候，却出现了：can't read "S": no such variable |
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zyj8119(金币+1):谢谢参与
zyj8119(金币+1):谢谢参与
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你可以把所有的输入写道一个tc脚本中, 比如名字为11.tcl 然后在11.tcl中写入： mol delete all mol load pdb KCSA-ALL.pdb foreach S { A B C D } { set seg [atomselect top "segname $S and chain C and protein"] $seg writepdb seg$S.pdb $seg delete } 然后在vmd的 Extensions → Tk Console 中直接source 11.tcl即可 当然了，首先你要确保在KCSA-ALL.pdb文件的目录下面，否则找不到pdb,也是白搭，或者你可以告诉KCSA-ALL.pdb的路径，总之，要确保KCSA-ALL.pdb能被找到 我建议你先把我给你的11.tcl复制，看行不行，因为你的错误确实很像你自己的疏忽所致，呵呵 |
8楼2010-12-20 09:22:43
2楼2010-12-19 19:17:32
3楼2010-12-19 19:33:13
4楼2010-12-19 20:35:47
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wjq87070812楼
2010-12-20 12:08
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zyj8119(金币+1):谢谢参与
