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liuzen1986

金虫 (正式写手)


[交流] 【求助/交流】请教霉菌生长曲线测定方法

我要测定霉菌的生长曲线,但是细菌那种测定方法好象不行,请高人指点,
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scelab(金币+10, EPI+1): 热心鼓励 2011-07-02 09:50:07
这张帖子被引用作为另一个帖子所提问题的解答,我好奇地进来看了一下,觉得这张帖子的问题还是没有解决,虽然帖子是老了一点,但是问题解决了却是好事。

首先讨论测定吸光度的问题。我培养过曲霉属(包括黑曲霉、黄曲霉、米曲霉、塔宾曲霉、棘孢曲霉、黄柄曲霉、亮白曲霉等)、青霉属(包括草酸青霉、嗜松青霉等),枝状枝孢霉种,根霉属,木霉属,还有很多没有鉴定过的真菌,超过一千株,发现除非是污染了细菌,不然真菌在液体培养(180rpm)时菌丝长了之后都会相互纠结成球或块状,所以测定OD值不能反映真菌的生长时期。假如培养液离心之后测定OD值,那么没有菌体存在了;假如不离心,那么取菌体不能反应培养液中菌体的含量,而且如果菌体恰好挡住了光栅投射点,那么就完全吸光,没有任何光透过,引起误差。所以就别想着测定OD值了,细菌可以,真菌不适合。

再来看看测定菌丝干重的问题。首先应该肯定这个方法,因为这个方法已经把菌丝考虑进去了,大方向没有错,但是细节却很需要注意,因为取样量要真实反映菌丝的含量,而且还要保持培养液体系的完整。第一,取样量要真实反映菌丝的含量存在困难,因为真菌是有菌丝的,菌丝一旦长了就容易纠结在一起成块或者球状,需要摇均匀才能取样,但是怎样才算均匀呢?这是不确定因素。第二,保持培养液体系的完整也存在困难,因为取样的过程中需要无菌操作,这个取样品过程是否能保持无菌操作,不让细菌长起来,存在隐患;第二,一瓶培养基取样多次之后还剩下多少毫升?会不会开始的时候是100毫升,七天之后只剩下50毫升?还有,在摇床或者发酵罐中,空气的流动也会带走水分的,会不会开始的时候是100毫升,七天之后取样10次每次5毫升,最后只剩下30毫升?

我有个办法可以避免上面提到的这些问题,那就是将这个真菌制取孢子悬浮液(浓度不在此处讨论),以相同的接种量接种到足够数量的相同体积的液体培养基中,在同一条件下培养,在每个取样时间点取出3瓶培养基用布氏漏斗抽滤,在烘箱中50-60度烘干至恒重,称重。这样做虽然工作量大了些,但排除了多次取样操作带来的细菌污染的隐患,液体体积变化的变数,直接反映了菌丝生长的时期,数据可信。

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13楼2011-07-02 01:08:32
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rainwander(金币+6): 不错的解答,辛苦了 2011-07-04 17:51:41
rainwander(EPI+1): 2011-07-04 17:51:46
引用回帖:
Originally posted by iaminxanadu at 2011-07-02 09:13:43:
首先应该透彻了解生长曲线的意义,为什么去做这个曲线?

微生物学引进生长曲线的概念来描述其生长与时间的关系。这个关系的意义在于使我们能更好把握它不同时期的生长状况。了解了这点不仅可以描述一些数量关系 ...

首先,培养基里如果有固体物质不利于微生物降解吸收,花生麸、豆粕、玉米、大米、马铃薯、木薯都要先将其粉碎,用80目筛子过滤取细粉,这样基质的表面积就增大,利于酶对其降解,要不然,大块的基质可能一直到菌丝老死都不能被利用完。当基质被粉碎后,可以很轻松地用滤布过滤除去,不影响真菌生长曲线的测定。你的树皮什么的有没有粉碎后过80目筛子取细粉,有没有用多少层纱布过滤取菌体?或者如果没有粉碎,是不是出于什么不得已的原因?是贴近工业生产要求还是怎么样?硕士学位论文一般不会被枪毙的,我代导师盲审过,我想枪毙那本学位论文导师都不让,最后我费劲脑汁去想在哪里能加分才好不容易凑足60分。你因为没做生长曲线而被枪毙,生长曲线在硕士论文中占那么大的比重?我很好奇是怎样的论文,能否透露一下?如果你签了保密协议,那就在保密期间看不了,就没办法了。那么你现在这个学位问题是怎样解决的,是不是重新做了生长曲线?怎样做的?

PMV的全称为package mycelium volume,即在一定的转速下离心得到菌丝体积百分比,但是真菌在生长对数期时菌丝和菌丝球是相互排斥,不能彻底离心下去的,不能测量其体积,所以也不靠谱。我在做果糖基转移酶的时候需要将培养1天的黑曲霉、棘孢曲霉、黄柄曲霉和塔宾曲霉离心收集菌体,结果就是离心不好。或者说可能我的实验如此,你的实验可能不是这样的,你当初培养的是什么真菌,用这个方法来做得到可信的结果的?

pH值的测定极其不靠谱,因为培养基里成分复杂,而且真菌在生长过程中,培养液里的pH值有可能变化极小,像我做的一株嗜松青霉,七天之内一直在6.0左右,对于这个青霉来说,七天已经差不多over了,pH值不能反映其生长周期。

耗糖,碳源可以是多糖,但是总糖不是全都是由碳源而生,因为氮源也含有碳,糖是羟基酮和醛,能不能确保加进去的氮源也不会产生糖?这个我没有做过,只是提个疑问和你探讨一下。

氮源和NADH我没有做过,如果你方便,关于原理和操作方法,可不可以提供些文献来让大家学习一下?我也想学习。
15楼2011-07-02 16:39:18
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引用回帖:
Originally posted by iaminxanadu at 2011-07-02 09:13:43:
首先应该透彻了解生长曲线的意义,为什么去做这个曲线?

微生物学引进生长曲线的概念来描述其生长与时间的关系。这个关系的意义在于使我们能更好把握它不同时期的生长状况。了解了这点不仅可以描述一些数量关系 ...

不知道会不会涉及你的隐私,如果涉及,那就不讨论了。
16楼2011-07-02 16:45:08
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rainwander(EPI+1): 2011-07-04 17:52:28
你说的这些我全都赞同,你说的补料确实是为了追求更高的产量,产量和生物量也是不一定对应的,当产量上升的时候,生物量不一定上升。我认为在工厂里做补料测产量而看轻生长曲线有以下原因:

1、工厂追求产量。产量就是产值,怎样做得好就怎样做,不用追求数据的完整性,对他们来说,生物量只是一项可有可无的数据,工厂要的是钱,所以采用最直接的方法。比如说什么pH值下发酵效果最好,他们可以把麦麸豆柏一股脑儿加下去,用硫酸调节pH值,发酵的时候测定产量就行,不用关心微生物长势如何的,太酸或碱了不长,不要紧,测产量就行,不用管微生物的生活质量。

2、工厂的实验室没有发表文章的压力,也不想把自己的生产经验给竞争对手分享,所以不会注意收集很多数据,使得实验完整,包括生长曲线这一项,更不会讨论生长曲线和产量的关系。当然,工厂要发表文章也是可以,但是会谨慎得多。

3、工厂的实验室可能没有做更高深实验所需的器材和药品。例如一个酒精厂,最贵的就是一台九十年代产的HPLC,测定一下有没有甘油之类的,其它的不用买。要说测定糖化用的根霉的长势如何,那肯定是测定不了的。

4、工厂这样做是经过摸索的,什么时候控制什么能得到什么结果,他们已经做过很多这种优化实验了,也许他们在摸索的时候测过生长曲线,但在生产的时候是采用成熟的路线来做的,所以也就不用再测了。也许在再摸索的时候会测定一下吧,到那时候可能就知道他们是怎样测定的了。

实验室的结果要经过小试、中试、工厂试验,规模逐渐加大,加上在扩大化的过程中会发现很多新问题,所以投入的人力物力是很大的,时间也很久,说十年都有可能。用来做试验,希望得到能创收的生物材料也会从最初的100种,到最后确定下来的一种,可能是百里挑一。我们的酵母曾经给中粮试过,但数据比不上我们在实验室做的好,到了工厂之后就比不上安琪酵母了,我们也正在进行选育,争取对安琪酵母有更大的优势。中粮试过的酵母不止是安琪酵母,也有全国各地的公司和实验室的酵母品种,所以这个战况也是惨烈的。

仔细看了你的两个回帖,觉得你并没有说明应该采用什么方法来测定生长曲线,更像是说生长曲线该不该测定。你想表达的意思似乎是“生长曲线不一定有必要测定,而应该更注重于某些目标产物的产量,以求更可能得到实际利益。为了得到更高的产量,可以考虑优化发酵条件,包括中间补料和控制pH值等”,是吗?我觉得这应该是学生和导师交流之后,最终由导师来作决定的,我没有想到楼主是不是应该问一下导师“是不是非要测定生长曲线不可”这个问题。
19楼2011-07-03 00:23:52
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rainwander(金币+5): 鼓励 2011-07-04 17:52:42
引用回帖:
Originally posted by iaminxanadu at 2011-07-02 23:27:00:
当时我写了申诉材料,三个盲审,就只有这个给了个“补实验,再答辩”当时来不及了,导师也支持我,但答辩主席不同意!

PS:答辩的人中,我一届同门分最低,下一届的师弟也是如此!

省科技厅的项目,假如是偏向于工业化的话,又是利用农副产品,那么评审要求可以适当宽一些,可以适当参考实际生产的情况。那个评委给评语也比较绝,可能是不怎么注意生产,或者本身就半桶水不懂装懂,懂一半剩下一半就瞎猜。就我的看法,生长曲线不是所有硕士学位论文都要测定的,要看这项数据对于实验的目的能不能产生参考价值。
20楼2011-07-03 00:31:48
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