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46437772木虫 (小有名气)
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[交流]
【原创】如何利用KEGG定位基因属于哪个代谢通路 已有14人参与
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有一些基因，打算确定他们分别和哪些代谢通路相关，想从KEGG里定位，请问有高手知道如何实现么？ 我把我摸索的提供一下，可能看起来很简单，但是对于从来不知道的（比如以前的我）朋友，找起来可能有点小麻烦  以Human的个别基因为例！ 首先打开网址：http://www.genome.jp/kegg/tool/color_pathway.html，  图中标示了红色1，2，3，为我们操作的地方！ 其中，1是下拉菜单，选择感兴趣的物种，默认是Reference Pathway，我选择Homo sapiens(Human)为例；2是输入感兴趣基因的地方，当然修改好格式的文档也可以直接上传，文本文档可以支持，其他的没试过。3是执行按钮。 此处，需要说明一下：fgcolor为前景颜色（个人理解），默认即可，无需关注；bgcolor为背景颜色，将来会在代谢通路中以此颜色突出显示你关注的基因，所以建议设置一下，我的示例数据如下图：  点击第一张图中的3，即Exec，应该出来下面的结果：  下面各位就可以点击相关的pathway看看你的基因位置啦 发这样的帖子挺费劲儿啊，第一次还搞错了，图片又重新上传编辑的！ 所以在此对曾经发帖的朋友表示一下敬佩和感谢！ 希望和感兴趣的朋友多多交流！ [ Last edited by 46437772 on 2010-12-15 at 22:01 ] |
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7楼2011-03-09 22:51:26
8楼2011-03-10 12:14:32