24小时热门版块排行榜    

查看: 2361  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

tpp001

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】用DL_POLY2.0跑完动力学以后,怎么看体系的势能是否达到平衡? 已有5人参与

我用dl_poly2.0跑完动力学以后,生成的轨迹文件history文件里面有势能这一项,我想查看势能是否达到平衡,怎么样才能把势能提取出来,大家都是怎么做到的?望帮忙谢谢!!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

迷茫在知识的海洋里,需要你的指导。thankyou
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tangdai

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
两种方式
1.显示DL_Poly输出的势能数据,如果随时间增加,波动减小并趋于某一稳定数值,可以看做达到平衡;
2.在Understanding Molecular Simulation一书中,第四章和附录D中,介绍通过block average来计算statistical error,进而判断计算时间是否足够长的方法。用同样的方法,可以检测势能是否达到平衡。

推荐第二个方法!
6楼2011-11-10 10:40:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

043114076

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-12-12 22:31:54
看statis 中的势能项就行了

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2010-12-12 19:52:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tpp001

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by 043114076 at 2010-12-12 19:52:04:
看statis 中的势能项就行了

恩,不知道是怎么在statis提取的,自己编程了吗?如果是自己编的程序,能不能发上来给我用一下,好吗??
迷茫在知识的海洋里,需要你的指导。thankyou
3楼2010-12-12 20:17:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+2):thank you 2010-12-13 10:41:46
zh1987hs(金币+2):thank you 2010-12-13 10:42:03
不需要编程,dlpoly 自带的gui就可以完成。具体的安装和使用需要看说明书,比较简单。
4楼2010-12-13 08:49:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +4 瞬息宇宙 2026-08-31 4/200 2026-09-01 14:58 by jiaoxg
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 15/750 2026-09-01 12:23 by icm639
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +13 Kittylucky 2026-08-27 14/700 2026-09-01 11:06 by feng6531
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
信息提示
请填处理意见