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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【讨论】[请教]一晶体为P-1,但解析的结果出人意料 已有7人参与

各位大侠,本菜鸟刚开始学习晶体解析,遇到这样一个奇怪的问题。测得一个晶体的空间群为P-1,解析结果为一个完整的分子和半个分子,本以为大功告成,可是在不断GROW下,发现那半个分子居然不断的生长,成了一条无限的长链,这岂不成了聚合物?改为P1求解,结果为四个独立的分子,与预期的结构相符。可是用PLATON检测一下,对称性又回到了P-1,新生成的RES文件与原来解的奇怪结构相同。请教各位大侠,这种情况是否见过?应该如何处理是好?
谢谢!!
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
Originally posted by sosom at 2010-12-06 20:18:33:
任何晶体都可以按P1解啊。GROW与空间群无关,你的P-1正常耶

关键是按P1感觉是正常的,而按P-1则是不正常的。图1为P-1的解,图2为生长的结果。而P1的解就是四个完整分子占据一个CELL。用户要的就是那个完整分子的晶体。

6楼2010-12-06 21:44:02
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
Originally posted by nanxuelove at 2010-12-07 20:59:29:
我最近解过类似的 用PLATON 可以解决

多谢指教,请问如何用PLATON解决这类问题?我改为P1求解后,又用PLATON的ADDSYM检查,它生成了P-1的RES文件,再解,其结果与原来解的无限链状错误是一样的。查看一下对称操作符为1-X,-Y,-Z。是不是这个操作符有问题?如何更改才能得到P-1下的正确结果?
谢谢!!
9楼2010-12-08 09:05:17
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