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王有朝

新虫 (小有名气)


[交流] 【求助/交流】引物设计问题

引物长度16bp,这对引物TM值在primer5.0上显示46摄氏度和44摄氏度,不知道能不能用啊?
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waiwaidou_1983

铜虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★
rainwander(金币+5):鼓励交流,谢谢参与。 2010-12-06 20:24:00
稍微短了点,我用过的最短的18bp,肯定没问题的。

因为短 所以退火温度会低

但我觉得你可以试一下,如果可以呢 就回来告诉我们16bp也OK
6楼2010-12-06 20:20:34
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rainwander

铁杆木虫 (知名作家)


你为什么会想它不可以用呢?
2楼2010-12-06 17:02:14
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fjt198719

木虫 (著名写手)



amisking(金币+1):鼓励交流! 2010-12-06 19:09:32
王有朝(金币+1): 2011-05-01 13:21:14
普通PCR和SOE-PCR本人从来都是手写,至今没问题,合成单子上80度和60度一起扩,用55度,扩得好得很,不过你设计的才16bp短了点吧
3楼2010-12-06 17:03:19
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傻子

木虫 (正式写手)


王有朝(金币+1): 2011-05-01 13:21:18
16bp的引物短了些吧,考虑20bp左右的,而且太短的引物对特异性也会造成影响
4楼2010-12-06 19:44:21
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