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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】引物的字母问题
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yellowaken

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】引物的字母问题

本人是环境专业的，没有多少分子生物学背景。最近在进行qPCR实验，最近在文献上看到primer的顺序非常的奇怪，为什么里面会有诸如T/K/M等字母，请各位高人指点。
引物RTC_F 的Sequence(5’→3’)是：ACCCTGGTCGGTGTKSTYTC
       RTC _R的Sequence(5’→3’)是：TCATGTAMGAGCCGACGAAGTC
（不会是书写错误的，因为该文献来自环境领域最权威的期刊。）


本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2668338&fpage=1
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1楼 2010-12-06 08:15:18
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rainwander

铁杆木虫 (知名作家)
★
yellowaken(金币+2):谢谢参与
这是兼并引物，那些T/K/M是兼并碱基，合成引物的时候都有说明
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8楼2010-12-06 09:21:43
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周_yan

木虫 (小有名气)
★
yellowaken(金币+2):谢谢参与
这些应该是一些兼并碱基，如A,g＝R；A,C＝M；A,T＝W；C,g=S；C,T＝Y；g,T＝K；A,T,C＝H；g,T,C＝B；g,A,T=D；A,C,g=V；A,C,g,T=N  等等。
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3楼2010-12-06 08:39:21
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tsingo

金虫 (正式写手)
★
yellowaken(金币+2):谢谢参与
兼并性引物，一个字母代表多个碱基。一般测序公司的说明上有
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11楼2010-12-06 12:49:21
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yellowaken

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 周_yan at 2010-12-06 08:39:21:
这些应该是一些兼并碱基，如A,g＝R；A,C＝M；A,T＝W；C,g=S；C,T＝Y；g,T＝K；A,T,C＝H；g,T,C＝B；g,A,T=D；A,C,g=V；A,C,g,T=N  等等。

谢谢，了解了

[ Last edited by yellowaken on 2010-12-7 at 03:51 ]
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13楼2010-12-07 03:48:36
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hujinling07楼
2010-12-06 09:20   回复  
yellowaken(金币+2):谢谢参与
silicare(金币-2):求助帖不可以纯表情回复的 2010-12-06 11:57:28
查看全部 14 个回答
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