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yellowaken

金虫 (小有名气)


[交流] 【求助/交流】引物的字母问题

本人是环境专业的,没有多少分子生物学背景。最近在进行qPCR实验,最近在文献上看到primer的顺序非常的奇怪,为什么里面会有诸如T/K/M等字母,请各位高人指点。
引物RTC_F 的Sequence(5’→3’)是:ACCCTGGTCGGTGTKSTYTC
       RTC _R的Sequence(5’→3’)是:TCATGTAMGAGCCGACGAAGTC
(不会是书写错误的,因为该文献来自环境领域最权威的期刊。)


本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2668338&fpage=1
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yellowaken(金币+2):谢谢参与
帮顶
2楼2010-12-06 08:25:21
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周_yan

木虫 (小有名气)



yellowaken(金币+2):谢谢参与
这些应该是一些兼并碱基,如A,g=R;A,C=M;A,T=W;C,g=S;C,T=Y;g,T=K;A,T,C=H;g,T,C=B;g,A,T=D;A,C,g=V;A,C,g,T=N  等等。
3楼2010-12-06 08:39:21
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zhaocy8903

木虫 (知名作家)



yellowaken(金币+2):谢谢参与
楼上正解
4楼2010-12-06 09:02:06
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biolinkphila

新虫 (小有名气)



yellowaken(金币+2):谢谢参与
楼上正解
5楼2010-12-06 09:13:18
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rainwander

铁杆木虫 (知名作家)



yellowaken(金币+2):谢谢参与
这是兼并引物,那些T/K/M是兼并碱基,合成引物的时候都有说明
8楼2010-12-06 09:21:43
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yellowaken(金币+2):谢谢参与
简并 not 兼并
10楼2010-12-06 12:02:55
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tsingo

金虫 (正式写手)



yellowaken(金币+2):谢谢参与
兼并性引物,一个字母代表多个碱基。一般测序公司的说明上有
11楼2010-12-06 12:49:21
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skkyy88888

铜虫 (著名写手)


呵呵呵。
12楼2010-12-06 13:20:40
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yellowaken

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by 周_yan at 2010-12-06 08:39:21:
这些应该是一些兼并碱基,如A,g=R;A,C=M;A,T=W;C,g=S;C,T=Y;g,T=K;A,T,C=H;g,T,C=B;g,A,T=D;A,C,g=V;A,C,g,T=N  等等。

谢谢,了解了

[ Last edited by yellowaken on 2010-12-7 at 03:51 ]
13楼2010-12-07 03:48:36
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周_yan

木虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by yellowaken at 2010-12-07 03:48:36:

谢谢,了解了

[ Last edited by yellowaken on 2010-12-7 at 03:51 ]

不客气,祝实验顺利!
14楼2010-12-07 08:16:15
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简单回复
x123v06楼
2010-12-06 09:18   回复  
yellowaken(金币+2):谢谢参与
silicare(金币-2):求助帖不可以纯表情回复的 2010-12-06 11:57:12
2010-12-06 09:20   回复  
yellowaken(金币+2):谢谢参与
silicare(金币-2):求助帖不可以纯表情回复的 2010-12-06 11:57:28
2010-12-06 09:24   回复  
yellowaken(金币+2):谢谢参与
silicare(金币-2)::求助帖不可以纯表情回复的 2010-12-06 11:57:43
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