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swq0021

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】DNA-这个电泳怎么跑呢？？？

初做电泳 很多东西不太了解 想向各位大侠请教下
我的DNA是个杂交的双链DNA 23bp   比较短
想跑个琼脂糖凝胶电泳 可是有人告诉我说这个分子量太小 要跑聚丙烯酰胺的
请问大侠们 这样的DNA跑哪种好些呢 凝胶的比例大概多少合适
跪谢了！

谢谢大家的回复，肯定是要用聚丙烯酰胺了，谢谢大家！
可是实验中还有个问题，胶的配置和缓冲液都是用的TBE，上样的DNA的溶液是BA溶液（20 mM的Tris , 0.5 M的NaCl ，PH8.0），加了溴酚蓝，通电后发现溴酚蓝动的很慢，而且偏着，歪七扭八的，师兄的样品是水溶液，没有这个问题，我的是盐的影响还是PH影响了呢？

[ Last edited by swq0021 on 2010-12-2 at 14:00 ]
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1楼2010-11-30 09:18:32
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谁伴我闯荡

至尊木虫 (著名写手)
★
swq0021(金币+1):谢谢参与
条带太小了 还是跑聚丙稀酰胺的吧 琼脂糖凝胶看不到的
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2楼2010-11-30 09:56:56
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skkyy88888

铜虫 (著名写手)
★
swq0021(金币+1):谢谢参与
聚丙稀酰胺
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3楼2010-11-30 12:15:49
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taotao4108

金虫 (正式写手)
★
swq0021(金币+1):谢谢参与
肯定要跑聚丙烯酰胺凝胶，具体可以参考分子生物学试验或者分子克隆等等，讲的很详细
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4楼2010-11-30 12:25:58
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空谷幽风

金虫 (正式写手)
★
swq0021(金币+1):谢谢参与
琼脂糖电泳用来分离0.2k-20k的片段，你的这个一定不能用琼脂糖电泳来跑
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5楼2010-11-30 12:30:05
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jhu132llh

荣誉版主 (知名作家)
★
swq0021(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by taotao4108 at 2010-11-30 12:25:58:
肯定要跑聚丙烯酰胺凝胶，具体可以参考分子生物学试验或者分子克隆等等，讲的很详细

这个是正解
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6楼2010-11-30 12:32:47
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hyw1989960

木虫 (正式写手)
★
swq0021(金币+1):谢谢参与
聚丙稀酰胺凝胶电泳吧！
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7楼2010-11-30 14:58:37
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-超越beyond

铁虫 (小有名气)
★
swq0021(金币+1):谢谢参与
聚丙稀酰胺
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8楼2010-11-30 17:31:18
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eileenjn

银虫 (小有名气)
★
swq0021(金币+1):谢谢参与
聚丙烯酰胺凝胶电泳，片段太小
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9楼2010-12-01 11:18:12
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yuanbo934

至尊木虫 (著名写手)
★
swq0021(金币+1):谢谢参与
12%的聚丙烯酰胺凝胶电泳
可以银染，EB染色也没问题。
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10楼2010-12-01 17:06:03
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huchuanlu5

银虫 (小有名气)
★
swq0021(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by skkyy88888 at 2010-11-30 12:15:49:
聚丙稀酰胺

同意以上见解，正确。
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11楼2010-12-01 18:45:35
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swq0021

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yuanbo934 at 2010-12-01 17:06:03:
12%的聚丙烯酰胺凝胶电泳
可以银染，EB染色也没问题。

谢谢你，谢谢大家的回复，肯定是要用聚丙烯酰胺了，谢谢大家！
可是实验中还有个问题，胶的配置和缓冲液都是用的TBE，上样的DNA的溶液是BA溶液（20 mM的Tris , 0.5 M的NaCl ，PH8.0），加了溴酚蓝，通电后发现溴酚蓝动的很慢，而且偏着，歪七扭八的，师兄的样品是水溶液，没有这个问题，我的是盐的影响还是PH影响了呢？
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12楼2010-12-02 13:52:53
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swq0021

新虫 (小有名气)
有人知道吗
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13楼2010-12-03 08:49:30
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hailiang1029

金虫 (正式写手)
★
swq0021(金币+1):谢谢参与
是有点小，不过如果用琼脂糖也可以，我做的70bp的分的很清楚，50bp也可以，只是胶浓度大一点，比如4%，然后跑的时候电泳很低，60—80V，跑几个小时，注意降温就好了，可以试一下，应该可以
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14楼2010-12-03 09:06:10
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zlrwindbell

木虫 (著名写手)
★
swq0021(金币+1):谢谢参与
聚丙稀酰胺
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15楼2010-12-03 09:12:08
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nanzheyi

木虫 (小有名气)
★
swq0021(金币+1): 谢谢参与
可以跑琼脂糖的，今天刚跑的，在紫外灯下可以看到，是28个碱基对的，琼脂糖浓度2%，有人用过3%的跑过十几个碱基对的，但是跑完之后凝胶放置三个小时后就看不到条带了。
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16楼2012-04-11 20:22:18
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可帅儿

银虫 (正式写手)
★
swq0021(金币+1): 谢谢参与
诶，我本来也打算问这个问题的。我的目的基因是200bp左右，用的是琼脂糖电泳跑的，除了个别的有条带，其他一律木有！很桑心啊~
是不是琼脂糖跑的都是500bp以上的？小片段用聚丙烯酰胺电泳？是垂直的还是水平的？
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17楼2012-04-13 18:31:31
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