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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
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04nylxb

木虫 (正式写手)


[交流] 【求助】请教CASTEP过渡态里面如何消除虚频?

请问,用CASTEP作过渡态搜索的时候,虚频该如何消除呢?我算了几个过渡态,都有两到三个比较大的虚频(用phonon计算的,看G点的频率,请见附图),2500i 500i 350i这样大小的。网上很多Guassian消除虚频的文章,那CASTEP该如何消虚频呢?

在网上看到,大家用这种方法在Gaussian里消虚频:“虚频振动坐标加和乘以系数加到相应的原子坐标上去”,请教,这里面相应的原子坐标是指反应物的还是过渡态的原子坐标?加完之后,继续优化。是否是指对过渡态进行构型优化;还是指加到反应物坐标后,对其进行构型优化,再次搜索过渡态?不胜感激。

求指点,在这点上卡了很久了……




2500i的振动如下





[ Last edited by 04nylxb on 2010-12-2 at 12:10 ]
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youzhizhe(金币+3):谢谢参与交流。 2010-12-01 21:26:24
04nylxb(金币+5):收到非常感谢,我把信息给出 2010-12-01 22:23:05
最好把三个的在震动模式给出来

感觉,过渡态的虚频跟一般稳定结构的虚频还不大一样,
建议:希望把三个虚频的详细信息给出(哪个官能团的,如何振动的),
1,重新搜索下呢。(估计不行)。
2,如果不行的话,加大一点力的收敛精度。
3,把过渡态的虚频的那几个原子固定了,然后只优化那部分不需要的虚频的原子。然后再优化下所有的原子
5楼2010-12-01 21:25:22
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04nylxb

木虫 (正式写手)


att,自己顶,求指点……
2楼2010-11-23 18:29:34
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04nylxb

木虫 (正式写手)


晕啊,求高人……
3楼2010-11-24 15:19:48
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04nylxb

木虫 (正式写手)


还是得自己顶,呵呵
4楼2010-12-01 08:45:40
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