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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
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04nylxb

木虫 (正式写手)


[交流] 【求助】请教CASTEP过渡态里面如何消除虚频?

请问,用CASTEP作过渡态搜索的时候,虚频该如何消除呢?我算了几个过渡态,都有两到三个比较大的虚频(用phonon计算的,看G点的频率,请见附图),2500i 500i 350i这样大小的。网上很多Guassian消除虚频的文章,那CASTEP该如何消虚频呢?

在网上看到,大家用这种方法在Gaussian里消虚频:“虚频振动坐标加和乘以系数加到相应的原子坐标上去”,请教,这里面相应的原子坐标是指反应物的还是过渡态的原子坐标?加完之后,继续优化。是否是指对过渡态进行构型优化;还是指加到反应物坐标后,对其进行构型优化,再次搜索过渡态?不胜感激。

求指点,在这点上卡了很久了……




2500i的振动如下





[ Last edited by 04nylxb on 2010-12-2 at 12:10 ]
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lfhuang

木虫 (著名写手)


★ ★
04nylxb(金币+1):收到,非常感谢 2010-12-02 16:48:34
youzhizhe(金币+2):谢谢交流。 2010-12-03 01:32:58
呵呵,谢谢楼主的回答和金币。一般来说是这样的,既然数值找到的过度态,人为就不要去改变它了,不然就变成非过度态了。除非搜索方法不好,这时建议用NEB方法+较高的力收敛判据。在过度态比较准确找到的前提下,出现一些不高的虚频,很可能是:
(1)电子自恰计算精度不高。因为振动频率的计算在收敛精度上要比总能来得苛刻。
(2)计算超原包太小导致neighbouring images之间的较小的相互作用会,从而出现一些意外的虚频。(我看楼主的超原胞好像较小,不知道够大了乎?)

祝:好运!


[ Last edited by lfhuang on 2010-12-2 at 16:28 ]
12楼2010-12-02 16:26:31
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04nylxb

木虫 (正式写手)


att,自己顶,求指点……
2楼2010-11-23 18:29:34
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04nylxb

木虫 (正式写手)


晕啊,求高人……
3楼2010-11-24 15:19:48
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04nylxb

木虫 (正式写手)


还是得自己顶,呵呵
4楼2010-12-01 08:45:40
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