应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】dmol 计算过渡态出现两虚频
汕头大学海洋科学接受调剂
51/1返回列表
查看: 2325  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

lishufei

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】dmol 计算过渡态出现两虚频

在dmol计算过渡态是出现两个虚频，一个-1300多，一个-50，动画显示-1300是我想要的，-50我不想要，想消去，怎么办？（我的初态结构和末态结构都优化好的）难道是反应路径有问题，还是初态或终态本身有问题？但只是个简单的金属解离氢分子反应，不会有很多种初态和终态啊？郁闷。。。。请教大家啦
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

麦子专属

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2010-11-21 09:50:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

MMCJC

新虫 (初入文坛)
★
lishufei(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
4楼: Originally posted by lishufei at 2010-11-21 10:36:42
还有个问题按照它的这种方法，那就是不怕虚频多就怕没虚频，只要有一种虚频是我们想要的那种反应就行啦？在这种虚频的图画里进行ts-opt就是想要的过渡态，不知道我的这种理解对不对啊？

在过渡态中显示的两个虚频 ...

请问楼主问题解决没，我也遇到类似的问题，不知道虚频该如何处理？
赞一下 回复此楼
7楼2019-06-27 16:59:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

lishufei

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by lishufei at 2010-11-21 09:50:19:
在dmol计算过渡态是出现两个虚频，一个-1300多，一个-50，动画显示-1300是我想要的，-50我不想要，想消去，怎么办？（我的初态结构和末态结构都优化好的）难道是反应路径有问题，还是初态或终态本身有问题？但只是 ...

补充一下，金属层下面有几层固定啦，应该不是它的原因吧？我看-50的虚频动画也是发生在分子上和底层没关系啊。还有看网上说消虚频把结构的坐标提出来在+虚频震动*0.5，具体怎么操作啊？本人连菜鸟都算不上有劳大家啦
赞一下 回复此楼
2楼2010-11-21 09:56:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishufei

金虫 (正式写手)
按照http://muchong.com/html/201007/2201973.html上说的，那我就直接打开-1350那个动画界面直接进行ts——opt就行啦？用不用计算频率啊？算出的图形一定和开始的ts_search不一样，那就是说过渡态是ts——opt的图像，能垒是ts_search里面计算出的barrier？是不是这样的啊？请教拿dmol做过过渡态的大侠啦？
赞一下 回复此楼
3楼2010-11-21 10:30:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishufei

金虫 (正式写手)
还有个问题按照它的这种方法，那就是不怕虚频多就怕没虚频，只要有一种虚频是我们想要的那种反应就行啦？在这种虚频的图画里进行ts-opt就是想要的过渡态，不知道我的这种理解对不对啊？

在过渡态中显示的两个虚频（-1300和-50），-1300是氢分子往开解离的震动形式很剧烈，-50的频率是氢分子基本上键长不变，只前后位置震动，很柔。我可不可以这样理解，过渡态在这个位置，有两种震动模式，因此它是不稳定位置，也是能量最高位，在这个位置我想要的是解离的模式，即对解离模式动画进行ts-opt，但我发现没法计算，提示说没有正常的模型什么的。
在对过渡态搜索后.xsd进行ts-opt只得到一个虚频（-1270）但与先前过渡态搜索.xsd结构有很大变化，氢原子之间的距离变化不大，是相对基地金属原子位置发生变化，那过渡态应该是一个虚频的ts-opt还是两个虚频ts-search？ts-opt优化出的能量要比Energy of transition state的能量低很多大约0.0348882Ha，这些怎么解释啊？

[ Last edited by lishufei on 2010-11-21 at 17:23 ]
赞一下 回复此楼
4楼2010-11-21 10:36:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 22408 312求调剂 +16 门路摸摸 2026-04-14 17/850 2026-04-14 23:59 by Xurambo2014
[考研] 271求调剂 +35 2261744733 2026-04-11 41/2050 2026-04-14 15:36 by zs92450
[考研] 284求调剂 +17 让我上岸吧阿西 2026-04-09 17/850 2026-04-14 14:44 by 不我拉绿卡
[考研] 考研求调剂 +12 子木呐 2026-04-12 13/650 2026-04-14 01:19 by 王珺璞
[考研] 求调剂 +12 璃茉一定上岸 2026-04-10 13/650 2026-04-14 00:08 by Equinoxhua
[考研] B区0809 ，数一英一，290 求调剂 +3 泠潍1111 2026-04-12 4/200 2026-04-13 20:35 by 学员JpLReM
[考研] 生物学调剂 +11 小冉要努力 2026-04-10 13/650 2026-04-13 11:46 by 电化学及催化
[考研] 考研二轮调剂 +10 故人?? 2026-04-09 10/500 2026-04-13 09:55 by szhize
[考研] 0831一轮调剂失败求助 +10 小熊睿睿_s 2026-04-11 10/500 2026-04-12 22:43 by 长弓傲
[考研] 一志愿浙大生物325分求调剂 +9 zysheng 2026-04-12 9/450 2026-04-12 22:31 by yuyin1233
[考研] 339求调剂 +8 hanwudada 2026-04-11 9/450 2026-04-12 15:36 by laoshidan
[考研] 277 数一104，学硕，求调剂 +21 瓶子PZ 2026-04-09 23/1150 2026-04-11 23:12 by labixiaoqiao
[考研] 一志愿厦大0856，306求调剂 +15 Bblinging 2026-04-11 15/750 2026-04-11 22:53 by 314126402
[考研] 0854调剂 +5 音像店听花鼓戏 2026-04-10 5/250 2026-04-11 10:49 by qingpingzhu
[考研] 0854调剂 +8 950824he@ 2026-04-09 8/400 2026-04-11 10:11 by zhq0425
[考研] 281求调剂 +11 觉得好的吧 2026-04-10 11/550 2026-04-11 09:35 by 逆水乘风
[考研] 调剂 +12 卷卷卷心菜_ 2026-04-09 13/650 2026-04-10 22:36 by Ftglcn90
[考研] 296求调剂 +6 汪！？！ 2026-04-08 6/300 2026-04-10 11:02 by mattzhming
[考研] 292求调剂 +9 笑笑袁 2026-04-09 9/450 2026-04-10 10:05 by LHGeng
[考研] 0860004 求调剂 309分 +6 Yin DY 2026-04-09 6/300 2026-04-09 10:19 by 啊李999
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭